Alde le jeune était né le 13 février 1547. Dès sa plus tendre enfance, son père veilla avec le plus grand soin à son éducation. Ses dispositions précoces semblaient seconder les voeux paternels, et donnaient les plus belles espérances. Mais son caractère ardent et son inconstance rendirent sa jeunesse orageuse et l'empêchèrent de remplir sa carrière d'imprimeur aussi bien qu'on aurait dû l'attendre de lui.
Alde n'avait que dix ans lorsqu'il donna la première édition d'un recueil intitulé : Eleganze della lingua toscana e latina, scelte da Aldo Manutio (1556). À l'âge de quatorze ans (1561), il fit paraître son Orthographiae Ratio, ouvrage où il expose un système ayant pour objet d'orthographier d'une manière régulière la langue latine.
De 1562 à 1565, il resta à Rome, où il avait été appelé par son père, qui lui fit faire une étude approfondie des monuments.
De retour à Venise (en 1565), il reprit la direction de l'imprimerie aldine et le cours de ses publications. Il épousa, en 1572, Francesca-Lucrezia, fille de Bernard Junte (Giunta), célèbre et habile imprimeur de Florence, possesseur d'une fortune honorable, et avec qui il forma une association avantageuse. En 1576, peu de temps après avoir fait paraître soit Commentaire sur l'Art Poétique d'Horace, accompagné d'une dissertation où il traite trente questions d'antiquités, il fut nommé professeur de belles-lettres et lecteur dans les écoles de la chancellerie, puis secrétaire du sénat de Venise. Mais son inconstance naturelle fut cause qu'il négligea tous ces avantages. En 1585, il abandonna sa patrie, soit établissement, ses emplois, pour aller occuper une chaire d'éloquence à Bologne, où il était demandé. Il accepta ensuite la chaire de belles-lettres qui lui était offerte à l'université de Pise, par le grand-duc François de Médicis. Enfin, ayant été nommé par Sixte-Quint à la chaire qu'avait occupée le célèbre Muret, ami de son père, il quitta Pise et vint à Rome, où, deux ans après (1590), Clément VIII