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De retour dans leurs pays, les explorateurs ont décrit les abondantes richesses naturelles du continent.
Très vite, exploration et commerce ne suffisent plus aux européens. Ils veulent prendre le contrôle des territoires et des lucratifs marchés africains.
Entre novembre 1884 et février 1885, un congrès international a lieu en Allemagne : la Conférence de Berlin. Durant cette réunion, les grandes puissances européennes se répartissent les territoires africains. Trente ans plus tard, l'Afrique est presque entièrement colonisée.
Parallèlement au commerce et à la politique, la religion joue à cette époque un rôle important dans le développement de l'Afrique. Les missionnaires remontent les fleuves du continent et pénètrent toujours plus loin vers l'intérieur. Ils apportent avec eux la quinine, un médicament capable de combattre la malaria, une maladie mortelle transmise par les piqûres de moustiques.
Les mouvements de résistance à la colonisation se développent dans toute l'Afrique. Pour coloniser les territoires, les européens livrent des batailles aux armées des royaumes locaux. Mais la plupart du temps, ces combats sont inégaux car les armes modernes des colons leur donnent un net avantage.
Pourtant certains royaumes remportent des victoires spectaculaires : en 1879, des Zoulous, faiblement armés, profitent de l'effet de surprise et de leur supériorité numérique pour anéantir un régiment britannique en Afrique du Sud.
Lorsque la guerre commença en Europe en 1914, les gouvernements coloniaux recrutèrent plus d'un million d'africains comme soldats. La Première Guerre mondiale causa quantité de souffrances aux populations africaines, car beaucoup d'entre elles furent engagées dans le conflit, de façon directe ou indirecte.
A la fin de la guerre, un nouveau