Bioinformatique et données biologiques

Cours d'introduction à la bioinformatique et de présentation des banques de séquences.
1ère partie

Equipe Bonsai (2014)

QUELQUES MOTS SUR LA BIOINFO

Connaissances

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Définition de la bioinformatique

Un domaine de recherche qui analyse et interprète des données biologiques, au moyen de méthodes informatiques, afin de créer de nouvelles connaissances en biologie.

Source : article présentant la bioinformatique, sur le site d'Interstices
Auteur(s) :
Isabelle Quinkal (Journaliste)
François Rechenmann (Chercheur)

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Définition de la bioinformatique en anglais : distinction entre
« Bioinformatics » et « Computational Biology »
 « Bioinformatics » applique des algorithmes, modèles statistiques dans l'objectif d'interpréter, classer et comprendre des données biologiques.

 « Computational Biology » développer des modèles mathématiques et outils associés pour résoudre des problèmes biologiques.

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Qu'est-ce que la bioinformatique ?
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L'approche in silico de la biologie
Trois activités principales :
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Acquisition et organisation des données biologiques
Conception de logiciels pour l'analyse, la comparaison et la modélisation des données
Analyse des résultats produits par les logiciels

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Quelques conseils
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Méfiez-vous des résultats donnés par les logiciels :
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La qualité des résultats est parfois diminuée au profit de la rapidité
Certains problèmes admettent un ensemble infini de possibilités
 Ce n'est pas toujours la solution la meilleure qui est trouvée
Beaucoup de logiciels ne font que de la prédiction
 Prédiction : dire ce qu'on prévoit, par raisonnement, devoir arriver. (wiktionnaire)

Méfiez-vous des banques de données :
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Les données se sont pas toujours fiables
La mise à jour n'est pas toujours récente

La réalité mathématique n'est pas la réalité biologique :
Les ordinateurs ne