Les micro-organismes eux-mêmes peuvent servir de nourriture pour les aliments humains (et pour les animaux). Cette idée a été suggérée dès le début du XXII siècle comme solution à la croissance rapide de la population humaine et au cortège de famines qu'elle laisse entrevoir dans l'avenir.

Plusieurs scientifiques croient qu'une industrie produisant des micro-organismes-aliments à bon marché pourrait fournir un complément alimentaire intéressant dans les périodes difficiles. En effet, ces micro-organismes-aliments peuvent être produits en grande quantité toute l'année sur des milieux relativement simples et peu onéreux comme la mélasse et des farines, ou encore, des sous-produits agricoles et même industriels.

Des micro-organismes-aliments sont actuellement commercialisés comme nourriture animale, mais très peu concernent l'alimentation humaine.
Durant la Première Guerre mondiale, les Allemands produisaient déjà des levures et une moisissure (Geotrichum candidum) comme aliments. Aujourd'hui, on trouve des usines de production de nourriture à base de levures dans différents pays européens, en Afrique du Sud, à Taiwan et aux États-Unis.

Dans le passé, les levures-aliments étaient des sous-produits de fermentations alcooliques industrielles (brasseries et distilleries) alors qu'aujourd'hui, elles sont cultivées exclusivement pour cet usage.
En Angleterre, on fabrique depuis 1981 des mycoprotéines avec la moisissure Fusarium graminearum. Elles sont aromatisées à la saveur de poulet et présentées sous forme de pâté. Elles ont l'avantage d'être riches en fibres et pauvres en cholestérol.
Protéines d'origine microbienne ou SCP
On qualifie de protéines d'origine microbienne ou SCP (single-cell protein) les produits comestibles (alimentation humaine et animale) formés exclusivement par des cellules microbiennes concentrées et séchées.
En plus d'être riches en protéines, ces aliments contiennent un grand nombre d'autres composés nutritifs. Les avantages de