Iso 22000

1079 mots 5 pages
LES PUCES A ADN
Rémi Bernard

Graphics courtesy of the National Human Genome Research Institute

Cellule Chromosome

transcription

traduction

Gène (ADN)
À l’échelle cellulaire

Transcrit (ARNm), Simple brin

Protéine

GENOME
(ensemble des gènes d’une cellule)

TRANSCRIPTOME
(ensemble des transcrits d’une cellule à un instant donné)

PROTEOME

(ensemble des protéines présentes dans une cellule à un instant donné

ETUDE DU GENOME

GENOMIQUE

ETUDE DU TRANSCRIPTOME ETUDE DU PROTEOME

POST-GENOMIQUE

Dans une cellule seulement une fraction des gènes est exprimée ...

Tissu nerveux

Tissu musculaire

Autre exemple: au cours d’une croissance bactérienne… Les conditions de milieu changent et les gènes exprimés aussi !
Phase Début de phase stat. stationnaire Phase Expo.

DO 600 nm

Temps (min)
Gènes de croissance (metabolisme…) Gènes de mobilité (flagelle) Gènes de carence… Gènes de survie (sporulation..) Gènes de défense (production d’antibiotique…)

Un des outils pour l’étude du transcriptome: les biopuces ou puces à ADN
Le but: détecter et quantifier chacune des différentes espèces d’ARNm présents dans la préparation. Analyser le transcriptome c’est identifier, à un temps t, et/ou dans une condition donnée, les séquences codantes du génome effectivement exprimées (transcrits, ou ARNm).

L’ ADNc ou ADN complémentaire exon intron ADN génomique, double brin

In vivo

…GAAATAAGCTGTTCTCTGCTTCAT…
Brin codant

…CTTTATTCGACAAGAGACGAAGTA…

transcription ARN messager, simple brin
(instable)

…GAAAUUCUGCUUCAU…
In vitro

rétro-transcription …CTTTAAGACGAAGTA…

ADNc, simple brin (stable)

L’ADNc ne contient que les régions codantes d’un gène (élimination des introns)

Fabrication des puces à ADN

LE BUT: représenter sur la puce l’ensemble des transcrits d’un génome et pouvoir les identifier

2 types de sondes fixées sur le support solide intron exon

ADN génomique du gène 1

ADNc Gene 1

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