le chemsketch
Le logiciel CHEMSKETCH permet entre autres choses d’éditer, représenter et analyser des formules chimiques et des molécules. Nous présentons ici les notions de base qui vous permettront de dessiner et retrouver certaines propriétés de ces dernières. Des tutoriels complets sont disponibles sur le site de la compagnie Advanced Chemistry Development (ACD) qui a réalisé le logiciel. Les notes qui suivent ne sont rien d’autre qu’un bref résumé de certains points saillants de ces documents, gratuits et très bien faits en passant. L’URL du site est le suivant : http://www.acdlabs.com/ .
1. Description générale de l’environnement (interface).
Voici l’environnement CHEMSKETCH (Version 12.0), tel qu’il apparaît à l’ouverture du logiciel.
On y trouve :
• La barre TITRE : qui indique le titre du fichier, ici noname01 suivi de l’extension .sk2 .
• La barre de MENU :
o Dans le menu PAGES la commande NEW ouvre un tout nouveau fichier, qui n’a rien à voir avec celui en cours, alors que la commande INSERT ajoute une feuille au fichier déjà ouvert. o Le menu TOOLS mérite d’être exploré en entier. Plusieurs commandes que nous verrons ultérieurement y sont présentes de même que leur raccourci correspondant. L’item GENERATE doit être vu, ne serait-ce que pour y apprendre que CHEMSKETCH peut donner le nom de certaines molécules dessinées. De plus, la liste se termine avec l’item CALCULATE dont vous aurez besoin pour calculer les propriétés des molécules. Attention au leurre: l’itemSTRUCTUREPROPERTIES du même menu ne donne pas les propriétés chimiques de la molécule ! o Le menu TEMPLATES (« MODÈLES ») lui aussi doit être examiné en détail. On y trouve, parmi plusieurs banques de données très intéressantes, les outils nécessaires à la réalisation des montages chimiques. Dans ce menu, il faut cliquer sur l’onglet TEMPLATEWINDOW. L’onglet TEMPLATEORGANIZER sert plutôt à définir des modèles personnels.