Cours 6 : Les statistiques avec R
XVII- Généralités
XVIII- Les formules
XIX- Les sorties
XX- Les fonctions génériques

XVII- Généralités
Fonctions d’analyse statistique disponibles

Package « stats » : contient les fonctions d'analyse statistique classiques (tests d’hypothèses classiques, modèles linéaires, distributions, résumés statistiques, séries temporelles, analyses multivariées). Il est chargé au démarrage. Accessibles avec library(help="stats") Packages spécifiques : d'autres packages de méthodes statistiques sont disponibles, distribués avec R ou à télécharger.
Exemples : class : fonctions pour classification boot : fonctions bootstrap stats4: fonctions stats utilisant S4 survival : analyse de survie

XVII- Généralités
Quelques fonctions dans « stats »:
Modélisation
SSlogis aov glm lm manova ksmooth step

Modèle logistique
Analyse de variance
Modèles linéaires généralisés
Modèles linéaires
Analyse de variance multivariée
Kernel Regression Smoother
Choix d’un modèle par l’algorithme Stepwise

Tests bartlett.test binom.test chisq.test cor.test
t.test
var.test wilcox.test ks.test

Test de Bartlett d’homogénéité de variances
Test Binomial exact
Test du Chi2
Test d’ Association/Correlation t-Test de Student de comparaison de moyennes
F Test de Fisher de comparaison de Variances
Test de rang de Wilcoxon
Tests de Kolmogorov-Smirnov

XVII- Généralités
Estimation
density ecdf Estimation de densité par noyaux
Fonction de répartition empirique

Analyse des données hclust Classifications hiérarchiques kmeans Classifications par partitionnement princomp Analyse en composantes principales prccomp Analyse en composantes principales dist Calcul de matrices de distance

XVIII- Les formules
Syntaxe des principales fonctions : les formules
Certaines fonctions statistiques (en particulier les fonctions de modélisation) travaillent sur des formules (?formula): fonction (formula=, data =…)