Rapport de microbiologie de l’environnement

1. Introduction

Lors de ces travaux pratiques, nous avons réalisé 2 expériences. L’une était d’ensemencer divers milieux de cultures avec différents extraits de sols afin d’observer la biodiversité des microorganismes présents dans ces extraits.
La seconde manipulation consistait en l’analyse de la diversité métabolique des microorganismes par la méthode sur ecoplates (Community-Level-Physiological-Profiling).

2.2. But de l’étalement d’extraits de sol sur boîte de Pétri

Nous savons maintenant que le sol n’est pas un « désert biologique » et qu’il contient une infinité de microorganismes (champignons et bactéries notamment). Le sol représente ainsi une des plus grandes sources de biodiversité inconnue à l’heure actuelle.
Le but de cette manipulation est de mettre en évidence les différents types de communautés de microorganismes vivant dans les sols (5 types de sol) en les étalant sur 6 milieux de cultures différents.
Les milieux utilisés diffèrent par leur composition en nutriments, et leur pH, ils nous permettrons donc d’isoler différents types de microorganismes en fonction de leurs besoins métabolique.
Parallèlement à l’ensemencement sur boîte de Pétri, nous avons pris la mesure du pH des différents sols à notre disposition. De cette manière, nous pouvions déjà nous faire une idée quant aux types de microorganismes vivant sur ces sols. Nous avons vu au cours que les champignons se développaient préférentiellement sur des sols acides et que les bactéries préféraient les sols neutres à basiques. Attention, cela ne veut pas dire que nous ne retrouverons que des champignons sur sols acides et des bactéries sur sol neutres-basiques!

2.3. Méthode de l’étalement d’extrait de sol sur boîte de Pétri

1. Étalement d’une goutte de suspension de sol à proximité du bord la boîte. 2. Réalisation de stries pour séparer autant que possible les différentes colonies à l’aide d’une oese