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Questionnaire Taxonomie

1. Définir la « taxonomie ». Différencier du mot « nomenclature »
2. Situer dans l’échelle taxonomique l’ »ordre ».
3. Donner la classification complète pour E.coli, en respectant les règles de nomenclature (mot à définir)
4. Différencier les critères phénotypiques et génotypiques utilisés pour la classification.
5. Comment est étudié l’ADN génomique bactérien ?
6. Comment sont exploitées les données phénotypiques ou génomiques pour arriver à une classification ?
7. Pourquoi l’ARN 16S est-il utilisé pour la classification phylogénétique des micro-organismes ?

1-La taxonomie est la science qui en Biologie étudie la classification des êtres vivants. Ce besoin de classification provient du fait que tous les organismes vivant actuellement et aussi ceux dont l'espèce est éteinte, proviennent d'organismes ancestraux, par le mécanisme complexe de l'évolution des espèces.La taxonomie est la science qui va aboutir à classer les êtres vivants de façon hierarchisée au sein de groupes appelés taxons. La nomenclature est un ensemble de règles qui permet à un instant donné de l'état de la systématique de nommer les taxons de façon non ambigüe et en adéquation avec les niveaux hierarchiques de la classification en cours.2- L’echelle est la suivante : règne/domaine/Phylum/classe/ordre/famille/genre/espèce 3- Pour E.coli : - règne: Procaryotae- domaine: Bacteria- phylum : Proteobacteria- classe: Gammaproteobacteria
- ordre: Enterobacteriales - famille: Enterobacteriaceae - genre: Escherichia - espèce : Escherichia coli | | | 4- La classification des bactéries entre elles repose sur plusieurs types d'observations et d'études. Les bactéries peuvent ainsi être classées et donc identifiées en fonction :

-de leur morphologie microscopique (bactérie de type coque, bacille, vibrion ; isolés, par deux, enchaînettes...)
-de leur morphologie macroscopique (taille, forme, couleur...