Toute la biochimie

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SCIENCES SUP

Cours
Licence • PCEM • Pharmacie

TOUTE LA BIOCHIMIE

Serge Weinman Pierre Méhul

TOUTE LA BIOCHIMIE
Serge Weinman
Professeur émérite à la Faculté de médecine Saint-Antoine, Paris. Ancien chef de service de biochimie et de biologie moléculaire de l’hôpital Rothschild, Paris

Pierre Méhul
Illustrateur

Illustration de couverture : Pierre Méhul

Ce pictogrammemérite une explication. Son objet est d’alerter le lecteur sur la menace que représente pour l’avenir de l’écrit, particulièrement dans le domaine de l’édition technique et universitaire, le développement massif du photocopillage. Le Code de la propriété intellectuelle du 1er juillet 1992 interdit en effet expressément la photocopie à usage collectif sans autorisation des ayants droit. Or, cettepratique s’est généralisée dans les

établissements d’enseignement supérieur, provoquant une baisse brutale des achats de livres et de revues, au point que la possibilité même pour les auteurs de créer des œuvres nouvelles et de les faire éditer correctement est aujourd’hui menacée. Nous rappelons donc que toute reproduction, partielle ou totale, de la présente publication est interdite sansautorisation du Centre français d’exploitation du droit de copie (CFC, 20 rue des GrandsAugustins, 75006 Paris).

© Dunod, Paris, 2004 ISBN 2 10 006734 6

Le Code de la propriété intellectuelle n’autorisant, aux termes de l’article L. 122-5, 2° et 3° a), d’une part, que les « copies ou reproductions strictement réservées à l’usage privé du copiste et non destinées à une utilisation collective » et,d’autre part, que les analyses et les courtes citations dans un but d’exemple et d’illustration, « toute représentation ou reproduction intégrale ou partielle faite sans le consentement de l’auteur ou de ses ayants droit ou ayants cause est illicite » (art. L. 122-4). Cette représentation ou reproduction, par quelque procédé que ce soit, constituerait donc une contrefaçon sanctionnée par les articlesL. 335-2 et suivants du Code de la propriété intellectuelle.

Table des matières

Introduction

1

PARTIE I
ARCHITECTURE ET LOGIQUE DES ÊTRES VIVANTS STRUCTURE DES BIOMOLÉCULES
CHAPITRE 1 • Aminoacides, peptides et protéines
Les α-aminoacides La chaîne polypeptidique et ses conformations Reploiement des chaînes polypeptidiques des protéines globulaires hydrosolubles Des motifs dereploiement, ou structures supersecondaires, sont formés à partir d’hélices α et/ou de brins β Les chaînes polypeptidiques sont organisées en domaines Les structures des protéines peuvent être réparties en trois classes Les protéines transmembranaires La prédiction de la structure tridimensionnelle des protéines est-elle possible ? Flexibilité conformationnelle des protéines Liaisons et interactions desprotéines Liaison d’un ligand sur un seul site
7 8 14 18 20 22 22 24 24 26 26 27

IV

Table des matières

Liaison coopérative d’un même ligand sur des sites multiples semblables : interactions homotropiques Liaison de plusieurs ligands sur des sites différents : interactions hétérotropiques Concept d’allostérie Modèle concerté Modèle séquentiel Les protéines sont-elles des démons deMaxwell ? Classification fonctionnelle des protéines Appendice : structures X et RMN des protéines

30 30 31 31 32 32 34 34 37 38 38 40 42 44 46 51 52 52 54 58 64 66 68 70 72 72 74 78 78

CHAPIRE 2 • Nucléotides et acides nucléiques
Les nucléosides Les nucléotides Liaison phosphodiester et acides nucléiques Acide désoxyribonucléique ou DNA Formes tridimensionnelles alternatives du DNA Acidesribonucléiques ou RNA

CHAPITRE 3 • Glucides et glycoconjugués
Structure linéaire des oses Centres d’asymétrie des oses : le glycéraldéhyde Filiation des oses Structure cyclique des oses Dérivés des oses La liaison glycosidique Amidon et glycogène Cellulose et chitine Glycosaminoglycanes Protéoglycanes Les glycoprotéines Les glycolipides Les lipopolysaccharides

Table des matières

V...
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