SBI 4U Thierno Sow 28 novembre 2012

Laboratoire : Séquençage d’ADN et étude phylogénique

But
Déterminer la séquence de Drosophila melanogaster et la comparé aux 4 autres séquences de Drosophila arizonae, Drosophila mettleri, Drosophila mojavensis et Drosophila nigrospiracula afin de déterminer les mutations ainsi que leur effet.
Hypothèse
En comparant les diverses séquences de Drosophila, on pourra remarquer que ce sont tous des mutations de type «substitution» qui auront un effet de mutation de contre-sens pour la grande majorité.
Matériel
- Copie d’une séquence d’ADN
- Tableau de codons
Méthode
Se référer au protocole de laboratoire «Séquençage d’ADN et étude phylogénique» remis par Mme Blake, dans le cours de SBI 4U, à l’école De La Salle, novembre 2012.
Résultats
Voici la séquence d’ADN pour la Drosophila melanogaster :
5’-ATTTTGAGGAGCTACTGTAATTACTACTTTATTATCAGCTATCCCTTACTAAGGTATAGATTTAGTTCAA
TGATTATGAGGTGGATTTGCTGTTGTTACTGCCACTTTAACTCGATTTTT-3’
Analyse
… 1. La séquence d’acides aminés de Drosophila melanogaster est :
Isoleucine, Leucine, Arginine, Sérine, Tyrosine, Cystéine, Asparagine, Tyrosine, Tyrosine, Phénylalanine, Isoleucine, Isoleucine, Sérine, Tyrosine, Proline, Leucine, Leucine, Arginine, Tyrosine, Arginine, Phénylalanine, Sérine, Sérine, Méthionine, Isoleucine, Méthionine, Arginine, Tryptophane, Isoleucine, Cystéine, Cystéine, Cystéine, Tyrosine, Cystéine, Histidine, Phénylalanine, Asparagine, Sérine, Isoleucine, Phénylalanine.
2. Il y a 3 types de mutations ponctuels car les mutations se passent au niveau des nucléotides. Une mutation silencieuse est une mutation qui n’a pas d’impact sur la protéine produite. Une mutation contre-sens est une mutation