TD 3 Les pigments rétiniens, témoins et traceurs de l’évolution

La rétine est composée de 2 types de photorécepteurs, les cônes et les bâtonnets.
Les cônes sont de trois types différents :
Cônes « bleus » contenant un pigment photorécepteur appelé opsine S (maximum d’absorption 420nm)
Cônes « verts » contenant un pigment photorécepteur appelé opsine M (maximum d’absorption 530nm)
Cônes « rouges » contenant un pigment photorécepteur appelé opsine L (maximum d’absorption 560nm)

Objectifs :
1) Montrer que les gènes codant les opsines constituent une famille multigénique (Partie A)
2) Justifier la place de l’Homme au sein des Primates grâce aux opsines, et tracer l’évolution (Partie B)

Partie A : Vous montrerez que les gènes codant les opsines constituent une famille multigénique, en utilisant le logiciel Anagene, et les deux documents ci-dessous. Document de référence1 : obtenir une famille multigénique à partir d’un gène ancestral

(D’après Bordas SVT 1S 2011)

Document annexe1 : localisation chromosomique des gènes codant les opsines (Bordas SVT 2011)

(D’après Bordas SVT 1S 2011)

 Utiliser les fonctionnalités du logiciel ANAGENE (voir fiche technique sous plastique) pour comparer les séquences des gènes codant les opsines chez l’Homme (Chemin d’accès au fichier : Harp  SVT logiciels Anagène  Fichier  ouvrir.
Choisir lecteur r (zone classe 1S)  double clic sur SVT  « genes.1.edi »)

 Construire sur feuille un tableau (matrice) indiquant les pourcentages de différences entre les trois séquences de gènes (gène opsine rouge en référence)

 Justifier le fait que ces molécules dérivent d’un gène ancestral commun (support : document de référence 1)

 Représenter schématiquement la succession de mécanismes aboutissant à cette famille multigénique, au cours du temps.

 Commenter brièvement votre schéma, en intégrant les informations apportées par le document annexe1.

Partie B : Vous justifierez la place de l’Homme au sein des primates, et