basse de donnees
Banque de composés chimiques
Banque de séquence
Banque de données médicales
Banque de données bibliographiques
Base de données des journaux et livres scientifiques.
DIFFERENTS TYPES DE BANQUES DE DONNEES EN BIOLOGIE On peut distinguer les banques dites généralistes et des banques spécialisées (Tableau 3 et 4), es premières ont pour vocation d’être les plus exhaustives possibles, de rassembler la totalité des séquences ou informations connues pour toutes les protéines de l’ensemble des espèces et ce sans expertise particulière. A l’inverse, les secondes se sont constituées autour de thématiques biologiques en vue de réunir les séquences d’une même espèce ou les séquences d’une même famille protéique pour toutes les espèces avec la plupart du temps intervention d’experts. Tableau 3 - Adresse Internet des principales banques généralistes Banques
Description
Adresses Internet
SWISS-PROT
Séquences protéiques annotées http://www.expasy.ch/sprot/ PIR
Séquences protéiques http://www-nbrf.georgetown.edu/pir/searchdb.html GenBank
Séquences nucléiques http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Web/Search/index.html EMBL
Séquences nucléiques http://www.ebi.ac.uk/ebi_docs/embl_db/ebi/topembl.html TrEMBL
Traduction automatique de l'EMBL http://www.ebi.ac.uk/ebi_docs/swissprot_db/retreival.html PDB
Structures tridimensionnelles http://www.pdb.bnl.gov La banque SWISS-PROT
La banque SWISS-PROT est très bien documentée (description de la fonction d'une protéine, organisation en domaine, modifications post-traductionnelles, variants, …) et possède de nombreux liens vers d'autres bases de données (bibliographiques, sites et signatures, acides nucléiques, structures 3D, pathologies, etc.).
La banque TrEMBL la base TrEMBL qui contient la