BIO/INFORMATIQUE
Cours d'introduction à la bioinformatique et de présentation des banques de séquences.
1ère partie
Equipe Bonsai (2014)
QUELQUES MOTS SUR LA BIOINFO
Connaissances
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Définition de la bioinformatique
Un domaine de recherche qui analyse et interprète des données biologiques, au moyen de méthodes informatiques, afin de créer de nouvelles connaissances en biologie.
Source : article présentant la bioinformatique, sur le site d'Interstices
Auteur(s) :
Isabelle Quinkal (Journaliste)
François Rechenmann (Chercheur)
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Définition de la bioinformatique en anglais : distinction entre
« Bioinformatics » et « Computational Biology »
« Bioinformatics » applique des algorithmes, modèles statistiques dans l'objectif d'interpréter, classer et comprendre des données biologiques.
« Computational Biology » développer des modèles mathématiques et outils associés pour résoudre des problèmes biologiques.
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Qu'est-ce que la bioinformatique ?
L'approche in silico de la biologie
Trois activités principales :
Acquisition et organisation des données biologiques
Conception de logiciels pour l'analyse, la comparaison et la modélisation des données
Analyse des résultats produits par les logiciels
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Quelques conseils
Méfiez-vous des résultats donnés par les logiciels :
La qualité des résultats est parfois diminuée au profit de la rapidité
Certains problèmes admettent un ensemble infini de possibilités
Ce n'est pas toujours la solution la meilleure qui est trouvée
Beaucoup de logiciels ne font que de la prédiction
Prédiction : dire ce qu'on prévoit, par raisonnement, devoir arriver. (wiktionnaire)
Méfiez-vous des banques de données :
Les données se sont pas toujours fiables
La mise à jour n'est pas toujours récente
La réalité mathématique n'est pas la réalité biologique :
Les ordinateurs ne