Fatima-Zohra BELKHAMSSA
Module : Suivi de Populations
Compte rendu présenté par : Fatima-Zohra BELKHAMSSA Recherche de traits génétiques associés à une résistance au pathogène Mes travaux de suivi de populations de Pinna nobilis et Pinna rudis depuis 2015 dans la côte ouest Algérienne. Fatima-Zohra BELKHAMSSA
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Interprétation
On remarque que ces protéines ont une structure similaire composée d'une région extracellulaire et d'une région intracellulaire. Leucine Rich Repeat (LRR), ou régions riches en leucine, se trouvent dans l'espace extracellulaire, qui s'étend du début de la séquence à environ 50 amines acides avant le récepteur TIR (Tab.I). En revanche, la région intracellulaire correspondant au second segment de la séquence est caractérisée par la présence d'un domaine récepteur particulier, le Toll-IL1-Receptor (TIR) (Tab.I).
Tableau I : caractéristiques des séquences obtenues pour chaque récepteur
Les figures 3, 5 et 7 montrent clairement que, selon le récepteur, la protéine obtenue …afficher plus de contenu…

On remarque que certaines lignes ont une "*" au niveau de la première colonne, indiquant que ces régions ont été préservées, par opposition à celles sans étoile (Fig. 9). De plus, cet alignement permet de voir que les allèles des hybrides partagent des caractéristiques génétiques avec Pinna nobilis et Pinna rudis ; un allèle spécifique pour chaque espèce.
Figure 9 : Alignement de la séquence TLR7 sur le logiciel MEGA11
Fatima-Zohra BELKHAMSSA
TP Suivie de population 8 Ces alignements ont été enregistrés dans plusieurs formats (.fasta,.meg,.nex) afin de