Enzymologie 1
Quelques définitions
Enzymologie = étude des enzymes
Etymologie : Du grec en- (dans, à l’intérieur de) et zumê (levain), car le levain contient des enzymes qui permettent la fermentation
Terme introduit en 1876 par Kühne
Première enzyme : diastase
Elles ont presque toutes le suffixe –ase (=cliver) sauf la trypsine
Tout ce qui est capable de catalyser une réaction chimique est une protéine, donc une enzyme est une protéine.
Enzyme = Catalyseur (=molécule qui agit à une concentration infime et qui accélère le résultat de la réaction, mais le résultat de la réaction est inchangée)
Les catalyseurs biologiques sont beaucoup plus efficaces que les catalyseurs chimiques.
La vitesse de la réaction est multipliée par 106 – 1012 ; et les conditions de réactions (température, pH …) sont plus douces.
A la fin de la réaction, l’enzyme est intacte, inchangée : théoriquement on peut l’utiliser indéfiniment, mais l’enzyme peut se dégrader (pour la conserver il faut la fixer sur un support).
Une enzyme est spécifique d’une réaction.
Isoenzymes : enzymes catalysant la même réaction sur le même substrat, mais ayant des structures protéiques différentes.
Exemple : la LDH tétramérique possède 2 types de protomères (H et M). Il en résulte 5 isoenzymes séparables par électrophorèse (H4, H3M, H2M2, H3 et M4)
La répartition des isoenzymes varie en fonction des organes (H domine dans le cœur, M dans le muscle).
La plupart des enzymes = protéines
Exception : certains acides ribonucléiques, les ribozymes
holoprotéines (uniquement des a.a.) monomériques
Exemple : la ribonucléase à 124 résidus d’AA, M=13700 Da holoprotéines oligomériques
Exemple : La lactate déshydrogénase à 4 protomères, M=150000 Da hétéroprotéines Partie protéines + Partie non protéines
Apoenzyme (partie prot) + cofacteur ou coenzyme = catalyse
Cofacteur : corps chimique intervenant obligatoirement dans une réaction enzymatique : pour transporter un substrat ; pour accepter un produit ;
comme