Les applications de la culture in vitro concernent La multiplication conforme, La culture de méristèmes, Le sauvetage d'embryons, L'haplodiploïdisation, L'obtention de protoplastes et L'obtention de protoplastes
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Multiplication conforme
Une plante peut être multipliée en masse de façon identique à partir de cellules ou d'un fragment d'organe. C'est la multiplication conforme. Elle peut être réalisée à partir de nœuds, de pousses axillaires. Elle ressemble au bouturage. En culture in vitro, les tissus se développent et donnent une plante entière, identique à la plante de départ.

Culture de méristèmes
Un méristème est constitué de cellules non différenciées qui sont à l'origine de tous les tissus de la plante. La culture d'un méristème permet d'obtenir une plante identique à la plante initiale. L'intérêt de la culture des méristèmes réside dans le fait que ce sont des structures indemnes de virus. Leur culture conduit à des plantes saines.
Sauvetage d'embryons
Le sauvetage d'embryon consiste à prélever un embryon précoce, pour le cultiver in vitro afin de le protéger contre les inhibiteurs du développement au niveau des tissus maternels (cas de croisements interspécifiques). Son sauvetage peut être aussi pour accélérer les cycles végétatifs.

Haplodiploïdisation
L'haplodiploïdisation consiste en l'obtention de plantes à partir des cellules reproductrices ou gamètes. Ces cellules contiennent une copie de l'information génétique qui est normalement présente dans une cellule sous forme de deux copies, les deux chromosomes homologues. Lors de la régénération, on peut arriver à doubler le stock chromosomique. Les individus obtenus sont des lignées pures, car ils ont la même information sur les deux chromosomes, ils sont homozygotes.
Obtention de protoplastes
Les protoplastes sont des cellules sans paroi pectocellulosique. Ils peuvent être obtenus à partir d'explants divers (fragments prélevés sur les tissus d'une plante, de préférence des limbes de