Microbio1
1) Tests pouvant être effectués en moins de 48 heures pour obtenir des informations sur l'identité du microorganisme : Les différents types de microscopie et colorations: a) optique: a. Contraste de phase à fond noir et a fluorescence : i. Noir: Bactérie vivante, mobilité ii. Fluorescence: Spécimen fluorescent, fluorochrome, ultraviolet, DAPI, Coloration Viable, Anticorps fluorescent b. Fond Clair : Avec coloration (spécimen mort), Gram c. Confocale Laser: Image 3D, rarement diagnostique b) électronique d. Transmission : Coupe, envoi d'électron, coloration métaux lourds (tungstène, uranium) e. Balayage : 3D, pas 24h. c) tests génomiques : f. FISH : Coloration Phylogénétique, colore un gène, étude phylogénique g. PCR : Amplification, puis Séquençage. d) Séquençage et phylogénie du gène de l'ARN ribosomique 16S : Pas utile dans situation 24h trop long
2) Caractéristique de la vie cellulaire (très rapidement)
3) Fonction de la cellule et structure interne
5) Différente options métabolique pour l'obtention d'énergie (très rapidement) 6) Diversité microbienne (tel que vu au CCC) STRUCTURES DES PROCARYOTES
Structure morphologique (structure peut-elle donner un indice sur la différenciation)
8) Structure et fonctions de la membrane plasmique et principale fonction de la membrane cytoplasmique Taille: Moyenne : 1 à 3 um procaryote, 2 à 200 um eucaryote
Formes bactérienne: p.64 : Coque, bacille, spirille, spirochète ...
Membrane Cytoplasmique: * Rôle: Diffusion, Conservation énergie, ancrage des protéines * Composition: * Groupement phosphate hydrophile = contour * Groupement lipidique hydrophobe = intérieur * Hopanoïde (structure) * Force Proton-motrice : Cycle de krebs, oxydo-réduction = apport ATP * Protéine de transfert * Liaisons Ester * Arché : Monocouche lipidique,