Paes
1302 mots
6 pages
PAES U1 BIOCHIMIE STRUCTURALE: DES AA AUX PROTEINESMarie-Dominique GALIBERT
UMR6061-CNRS Institut de Génétique et Développement de Rennes Bat 8 - 1er étage
Pôle Molécules Service de Génétique Moléculaire et de Génomique Médicale CHU de Rennes - Hôpital Pontchaillou
1
BIOCHIMIE STRUCTURALE: DES AA AUX PROTEINES
I. II. III.
LES ACIDES AMINES LES PEPTIDES / PROTEINES - STRUCTURES LES PEPTIDES / PROTEINES - FONCTIONS
2
CHAPITRE I: LES AMINO-ACIDES
3
Cation
Anion
R H CH NH3
COOH pK pK1 C
R H CH NH3
+
COO
-
R CH H p K2 pKN
COO
-
NH2 pH alcalin
pH acide
pKC: Dissociation de la fonction acide pH= 2-3 pKN: Dissociation de la fonction ammonium pH ≈ 10 pHi: Point Isoélèctrique
4
Cation
Anion
R
CH NH3
COOH pK pK1 C
R
CH NH3
+
COO
-
R p K2 pKN
CH NH2
COO
-
pH acide
pH alcalin
pKC: Dissociation de la fonction acide pH= 2-3 pKN: Dissociation de la fonction ammonium pH ≈ 10 pKR: Dissociation du groupement R
5
pKC: Dissociation de la fonction acide pK1= 2.2 pKN: Dissociation de la fonction ammonium pK2= 9.21 pKR: Dissociation du groupement R pKR= 10.46
6
7
STEREO-ISOMERIE: géométrie dans l’espace
En fonction de la position NH2, deux configurations possibles => Série L - Série D
L
D
8
9
2 AA
=>
Liaison Amide = Liaison Peptidique
R
CH NH2
COOH + H2N
CH
R'
R
CH NH2
CO
NH
CH
R'
COOH
COOH
10
Acides Aminés INDISPENSABLES
- Valine - Leucine - Isoleucine - Thréonine - Méthionine - Lysine - Tryptophane - Phénylalanine
11
Abbréviations
A R N D C Q E Ala Arg Asn Asp Cys Gln Glu G H I L K M F Gly His Ile Leu Lys Met Phe P S T W Y V Pro Ser Thr Trp Tyr Val
12
ACIDES AMINES ALIPHATIQUES
Glycocolle
AA Ramifiés
13
ACIDES AMINES HYDROXYLES
AA Aromatique
14
ACIDES AMINES SOUFRES
15
CYSTINE : produit de déshydrogénation de deux cystéines