PAES U1 BIOCHIMIE STRUCTURALE: DES AA AUX PROTEINES
Marie-Dominique GALIBERT
UMR6061-CNRS Institut de Génétique et Développement de Rennes Bat 8 - 1er étage

Pôle Molécules Service de Génétique Moléculaire et de Génomique Médicale CHU de Rennes - Hôpital Pontchaillou

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BIOCHIMIE STRUCTURALE: DES AA AUX PROTEINES

I. II. III.

LES ACIDES AMINES LES PEPTIDES / PROTEINES - STRUCTURES LES PEPTIDES / PROTEINES - FONCTIONS

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CHAPITRE I: LES AMINO-ACIDES

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Cation

Anion

R H CH NH3

COOH pK pK1 C

R H CH NH3
+

COO

-

R CH H p K2 pKN

COO

-

NH2 pH alcalin

pH acide

pKC: Dissociation de la fonction acide pH= 2-3 pKN: Dissociation de la fonction ammonium pH ≈ 10 pHi: Point Isoélèctrique

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Cation

Anion

R

CH NH3

COOH pK pK1 C

R

CH NH3
+

COO

-

R p K2 pKN

CH NH2

COO

-

pH acide

pH alcalin

pKC: Dissociation de la fonction acide pH= 2-3 pKN: Dissociation de la fonction ammonium pH ≈ 10 pKR: Dissociation du groupement R

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pKC: Dissociation de la fonction acide pK1= 2.2 pKN: Dissociation de la fonction ammonium pK2= 9.21 pKR: Dissociation du groupement R pKR= 10.46

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7

STEREO-ISOMERIE: géométrie dans l’espace

En fonction de la position NH2, deux configurations possibles => Série L - Série D

L

D

8

9

2 AA

=>

Liaison Amide = Liaison Peptidique

R

CH NH2

COOH + H2N

CH

R'

R

CH NH2

CO

NH

CH

R'

COOH

COOH

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Acides Aminés INDISPENSABLES
- Valine - Leucine - Isoleucine - Thréonine - Méthionine - Lysine - Tryptophane - Phénylalanine

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Abbréviations
A R N D C Q E Ala Arg Asn Asp Cys Gln Glu G H I L K M F Gly His Ile Leu Lys Met Phe P S T W Y V Pro Ser Thr Trp Tyr Val

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ACIDES AMINES ALIPHATIQUES

Glycocolle

AA Ramifiés
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ACIDES AMINES HYDROXYLES

AA Aromatique
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ACIDES AMINES SOUFRES

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CYSTINE : produit de déshydrogénation de deux cystéines