Rapport de stage

Pages: 49 (12250 mots) Publié le: 27 mai 2013
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Master Professionnel BIBS
BioInformatique et BioStatistiques

Mémoire de stage de fin de 2éme année

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Stage effectué à :

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Arnaud LEBRUN

Soutenu le : 04/09/2007

Maître de stage : Emmanuelle GICQUELLO
Responsable de formation : Alain DENISE - Michelle TERMIER
Remerciements





Je tiens à remercier Messieurs Michel GERLICHER, AlainMERCERON et Madame Florence PENHOUET de m’avoir accueilli au sein de leur entreprise et de m’avoir fait confiance.

Un très grand merci à toute la « team SPLIMS » (Nourredine, Aurélien, Steph, David S, David G, Mariam, Myriam, Fred, Imane …) pour votre accueil, la bonne humeur de tous les jours. C’est un plaisir pour moi d’avoir pu intégrer votre équipe et travailler à vos côtés.

Un grandmerci également à Emmanuelle GICQUELLO, ma tutrice, pour son aide précieuse, ses encouragements et sa gentillesse.

Encore merci…
Introduction


Mon stage s’est effectué dans l’entreprise SPLIMS (SPL) groupe LabVantage. Mon contrat a commencé le 06 mars 2007 pour se terminer le 06 Septembre 2007. Mes missions au sein de cette entreprise ont été de paramétrer le progiciel SapphireTM pourdifférents projets en cours de développement ainsi que de participer à leurs cycles de vie.

SPLims se transcrit littéralement par : Solutions et Prestations de Lims, (Lims vient de Laboratory Information Management Systems). Un Lims est un Système de gestion des données des Laboratoires. Autrement dit, SPLims est une société positionnée dans une niche spécifique : l’informatique de gestion et detraitement des données scientifiques des laboratoires de recherche et développement.
Le LIMS présenté par SPLims s’appelle SAPPHIRE, il s’agit d’un progiciel qui peut être intégré et implémenté dans les laboratoires d’analyse de différents secteurs d’activité comme :
▪ La pharmacie
▪ Le cosmétique
▪ La chimie et pétrochimie
▪ L’agro-alimentaire
▪ L’environnement
▪ LesBiotechnologies
Le domaine de la biologie y est donc très présent et c’est dans ce contexte que j’ai pu appliquer ma double compétence en informatique et biologie afin de mener à bien les missions qui m’ont été confiées.
Ce document a pour objectif de présenter mon entreprise et le service dans lequel s’est déroulé ma mission. Pour ce faire, je vais tout d’abord commencer par expliquer ce qu’estun LIMS, le domaine d’activité de la société. Puis je présenterai la société SPLims et j’exposerai les outils que j’ai utilisés pour réaliser les applications LIMS, notamment le progiciel SapphireTM. Et enfin je ferai un point sur les différends projets auxquels j’ai participé et les missions qui m’ont été confiées au cours de mon stage.Remerciements…………………………………………………………………………………2
Introduction…………………………………………………………………………………….3
I. Qu’est ce qu’un Lims : 5
A. Les LIMS : une évolution étroitement liée à celle des besoins de l'entreprise... 5
B. Concrètement, que sont les LIMS? 6
II. Présentation de l’entreprise 7
A. Historique 7
B. Les principaux marchés et clients de SPL 7
C. Structure de l’entreprise 8
III. Le progiciel Sapphire LIMS 10
A.Fonctionnalité 10
B. Architecture 11
C. L’application 13
1. Les éléments constituant l’application 13
2. Les outils de développement et de paramétrage 16
IV. Projet : Laboratoire d’analyse 19
A. Présentation du projet 19
1. Le Lot 1 : gestion des demandes d’analyses et échantillons 19
2. Le Lot 1 bis : Gestion des instruments et consommables 20
B. Les différentesmissions effectuées 21
1. Formation à l’outil : 21
2. Compréhension de l’application actuelle : 21
3. Développement du Lot 1 bis Instrument : 21
4. Test 21
5. Transfert de compétence : 22
6. Traitements des retours du Lot 1 : 22
7. Rédaction des Spécifications Fonctionnelles Détaillés (SFD) du Lot 1 bis Stock: 22
8. Développement du Lot 1 bis...
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