Chapitre 1 : Le Cimetière des Livres oubliés
Daniel Sempere, orphelin de mère, est élevé par son père, un libraire. Lorsqu’il commence à ne plus se souvenir de sa maman, son père l’emmène au Cimetière des Livres oubliés, gardé par Isaac. Daniel choisit L’Ombre du vent, un roman de Julián Carax.
Chapitre 2 : 1945-1949 Jours de Cendre
Daniel s’interroge autour du roman trouvé et de son auteur. Il demande de l’aide à Gustavo Barceló et apprend ainsi qu’il détient le seul exemplaire du titre, les autres ayant mystérieusement brulé. Le jeune garçon fait également la connaissance de Clara, dont il tombe amoureux. À la même époque, il croise une silhouette d’homme semblable à celle décrite dans L’Ombre du vent.
Chapitre 3 : 1950-1952 Malheur et compagnie
Abandonné par Clara lors de son seizième anniversaire, Daniel croise à nouveau la silhouette mystérieuse qui veut acheter L’Ombre du vent ; Daniel refuse. Convaincu que l’étranger va s’en prendre à Clara, Daniel se rend chez les
Barceló pour la protéger et récupérer l’exemplaire qu’il lui a offert. Il fait par la même occasion la connaissance d’un vagabond, Fermín Romero de Torres. Daniel décide ensuite de cacher le livre dans un endroit sûr, au Cimetière des
Livres oubliés. Isaac lui apprend certaines choses sur Carax.
Chapitre 4 : 1953 Trompeuses apparences
Le père de Daniel engage Fermín à la librairie. Daniel croise Laín Coubert, l’homme au visage brulé. Le jeune homme renoue avec son ami d’enfance Tomás Aguilar. Un inconnu entre dans la librairie et y laisse une photographie ancienne.
Chapitre 5 : 1954 Ville d’ombres
Daniel rencontre par hasard Bea, la soeur de Tomás, et ils promettent de se revoir. Daniel se rend à la chapellerie
Fortuny pour en apprendre davantage sur Carax : il découvre plusieurs indices et demande de l’aide à Fermín. Daniel également reçoit la visite de Fumero, qui le menace.
Daniel décide de se rendre à la demeure des Aldaya, et chez Nuria, qui a bien connu Julián.
Fermín