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Malgré son nom, la "bioinformatique" ne doit pas être confondue avec une simple application aux données biologiques, des concepts et des outils de l'informatique traditionnelle.
Pour les anglo-saxons, le terme " bioinformatics " définit précisément la discipline consacrée à l'étude des séquences et des structures biologiques, contrairement au terme " biocomputing " qui correspond plutôt au traitement sur ordinateur des données biologiques.
En français, effectivement, le terme " bioinformatique " peut introduire une confusion en suggérant qu'une implication forte des informaticiens dans cette discipline est nécessaire.
La Bioinformatique est donc la discipline qui analyse l'information biologique essentiellement sous la forme de séquences génétiques, de séquences protéiques et des structures génétiques et protéiques correspondantes.
Les défis principaux de la bioinformatique sont l'identification des gènes et la prédiction de leur fonction, deux problèmatiques au centre de la "génomique fonctionnelle".
La bioinformatique est constituée par l'ensemble des concepts et des techniques nécessaires à l'interprétation de l'information génétique (séquences) et structurale (repliement 3D). C'est le décryptage de la " bio-information " (" Computational Biology " en anglais). Son but est d'effectuer la synthèse des données disponibles, d'énoncer des hypothèses (ex. : comment les protéines se replient ou comment les espèces évoluent), et de formuler des prédictions (ex. : localiser ou prédire la fonction d'un gène).
Objectifs de ce cours :
Ce cours est une initiation à la pratique de la bioinformatique plutôt qu'un véritable enseignement théorique de la bioinformatique.
Il est destiné à un public d'étudiants néophytes ayant besoin de bioinformatique pour aller plus loin dans la compréhension et dans l'acquisition des connaissances de la génomique et de la protéomique.
Les objectifs que doit se fixer l'étudiant sont les suivants :
Le premier objectif, plutôt