Génomique

 LE SEQUENCAGE GENOMIQUE SOUS DIFFERENTS ASPECTS L'émission « Oeil sur l'avenir » a lancé, la semaine dernière, un débat sur le séquençage génomique. Jane Doe présidente de GENOfutur, un laboratoire américain de séquençage et Marie Dupond membre de la CCNE ont été les invités de ce débat. Ce sujet d'actualité amène à se poser la question principale : le séquençage intégral du génome peut-il être un bien de consommation ? A la question posée par le médiateur quel sont les enjeux impliqués

LA GÉNOMIQUE DR Chaoui N. Département de Biologie Animale Université Frères Mentouri Constantine c DEFINITION • La génomique est une technologie récente qui étudie les génomes en leurs totalité. • l’Étude ne porte pas sur un seul gène (génétique) mais porte sur un Σ de gènes contenues dans un organisme = génome. • Étudie leur localisation, leur séquence, leur fonctions et leurs interactions. • Le génome d’un être vivant est constitué d’ADN, molécule qui comprend dans l’enchainement linéaire

gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed Banque de données bibliographiques: tous les articles publiés dans le domaine de la biologie et médecine sont répertoriés depuis 1960 environ. OMIM http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Omim/searchomim.html Banque de données génomiques: donne des informations sur les gènes humains, leur localisation sur le génome et avec quelles maladies ils sont associés. EntrezGene http://www.ncbi.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene Banque de données qui donne des informations sur les gènes

stricte acceptation de cette définition en excluerait toutes les séquences protéiques déduites par traduction conceptuelle de séquences nucléotidiques (c'est à dire l'immense majorité de celles qui peuplent les banques), ainsi que les séquences d'ADN génomique obtenues par assemblage de fragments et qui sont des consensus calculés à partir des alignements des fragments chevauchants. Cependant, les banques généralistes nucléotidiques et protéiques sont considérées comme des banques de données primaires

d'Europe et d'échange systématique et approfondi avec nos partenaires de la collaboration internationale Nucleotide Sequence Database (INSDC). * Ensembl - vertébrés génomes Parcourir un génome Le projet Ensembl produit bases de données génomiques pour les vertébrés et d'autres espèces eucaryotes, et rend cette information disponible gratuitement en ligne. Génomes populaires HumanGRCh37 SourisGRCm38 Le poisson zèbreZv9 Haut du formulaire Toutes les génomes Voir la liste complète de

(ensemble des gènes d’une cellule) TRANSCRIPTOME (ensemble des transcrits d’une cellule à un instant donné) PROTEOME (ensemble des protéines présentes dans une cellule à un instant donné ETUDE DU GENOME GENOMIQUE ETUDE DU TRANSCRIPTOME ETUDE DU PROTEOME POST-GENOMIQUE Dans une cellule seulement une fraction des gènes est exprimée ... Tissu nerveux Tissu musculaire Autre exemple: au cours d’une croissance bactérienne… Les conditions de milieu changent et les gènes exprimés

Pourquoi la transgenèse? Permet d’étudier la fonction des gènes -développement embryonnaire -organogenèse -pathologies humaines http://www.hhmi.org/biointeractive/media/transgenic_mice-sm.mov La nouvelle génétique expérimentale • Génomique fonctionnelle: étude de la fonction par la dysfonction • Validation d’une hypothèse: gène ou mutation candidate • Créer un modèle expérimental de maladie humaine – Etudier les mécanismes physiopathogéniques de la maladie – Tester des stratégies thérapeutiques

Mohammedia Génétique moléculaire RÉALISÉE PAR: LAKDALI KHAWLA Encadré par: Pr M.M ENNAJI PLAN             Introduction Taxonomie et classification Organisation structurale Observation au ME Organisation génomique Biologie moléculaire Cycle de réplication Pathologie Traitement vaccin Apport en biotechnologie conclusion INTRODUCTION Les Iridoviridae forment une famille des virus à ADN qui peuvent infecter les invertébrés et les vertébrés poïkilothermes

produire des connaissances, des biens et des services » Entre 2004 et 2007, tous les médicaments chimiques et biologiques ont fait appel à un moment ou à un autre de leur développement aux biotechnologies. INNOVATION ET R&D PHARMACEUTIQUE Genomique Génomique fonctionnelle Informatique moléculaire Medicinal Chem BioInformatique Proteomique Chimie combinatoire Criblage à haut-débit Tests cellulaires Identification Validation de cibles de la cible thérapeutiques Identification de molécules têtes

Partie 1: INTRODUCTION 1. Notions de base en bioinformatique et genomique Extraits du rapport nº 20 du Sénat, F. Sérusclat, 1999 : Domaine fondateur de la génomique, la bio-informatique est constituée de l'ensemble des concepts et des techniques nécessaires à l'acquisition et à l'interprétation de l'information "génétique". Elle seule permet de gérer cette information, qui est quantitativement considérable… La Génomique: la génomique est l'étude des génomes, de leur organisation, et de leur évolution