Lysine décarboxylase

immobiles - Aéro-Anaérobies Facultatifs - oxydase – - nitrate réductase + - fermentative du glucose - lactose -, - H2S + (ou -) - uréase – - lysine décarboxylase + - utilisant la voie des acides mixtes R.M + - indole – - ne possédant pas la béta-galactosidase Genre : Shigella - uréase – - Lactose – - désaminase – - lysine décarboxylase – - H2S – - Acétoïne – - Citrate – (comme seule source de carbone sur milieu citrate de Simmons ) - immobiles. Genre : Klebsiella Enterobacter

Recherche des décarboxylases et dihydrolases : Principe : La décarboxylation des acides aminés libère le groupe carboxyl sous forme de CO2 et une amine. COOH R - CH - ----------> CO2 + R - CH2 NH2 NH2 Les décarboxylases sont induites en milieu acide(pH‹6) et la présence de sucres fermentescibles, par acidification du milieu ,favorise leur synthèse.Elles agissent en condition d'anaérobiose . - La lysine décarboxylase ( LDC) transforme la lysine en cadavérine

utilisé dans l'identification des Enterobacteriaceae.   | |   Composition du milieu   Composition en grammes par litre d'eau distillée.   Extrait de viande de bœuf   | 3g | Extrait de levure | 3g | Peptone (riche en lysine) | 20g | NaCl      | 5g | Citrate ferrique | 0,3g | Thiosulfate de sodium | 0,3g | Lactose | 10g | Glucose | 1g | Rouge de phénol (solution à 1%)   | 5mL | Agar | 12g

Aérobie Mésophile GLY: Glycérol GN: Gélose Nutritive IND: Indole JORADP Journal Officiel de la République Algérienne LAC: Lactose LDC: Lysine Décarboxylase MAL Maltose MAN: Mannitol MAn: Mannose MEGA: Molecular Evolutionary Genetics Analysis MEL Mélibiose MH: Muller Hinton NJ: Neighbor- Joining ODC: Ornithine- décarboxylase ONPG: Ortho- Nitro- Phényl- beta- Galactosidase OTU: Operational Taxonomic Unite RAF: Raffinose RHA: Rhamnose RIB: Ribose RM: Rouge de

nutritive ordinaire CIT Trisodium citrate VP Vosges-Proskauer GEL Gélatine ADH Arginine DiHydrolase LDC Lysine Décarboxylase ODC Ornithine Décarboxylase URE Urée AVANT-PROPOS Présentation du LPEE : Laboratoire Public d’Essais et d’Etudes Le Laboratoire Public d'Essais et d'Études est une société anonyme d'économie mixte, au

laboratoire : - le L-Tryptophane - la L-Phénylalanine - la L-Lysine NB : il existe des isomères L et D des aa. Mais dans les protéines, seuls les isomères L sont présents. 3.1.4.1. La Tryptophane Désaminase TDA  catalyse la désamination oxydative du tryptophane Doc 3a 3.1.4.2. La Phénylalanine Désaminase PDA  catalyse la désamination oxydative de la phénylalanine Doc 3b 3.1.4.3. La Lysine Désaminase LDA  catalyse la désamination oxydative de la lysine Doc 3c 3.1.4.4. Techniques de Mise en Évidence  PRINCIPE

Recherche de décarboxylase: - Il existe des bactéries qui possèdent des décarboxylase spécifiques de certains acides aminés en particulier: la lysine, l’arginine et l’ornithine. - Ces décarboxylase sont respectivement: - La lysine décarboxylase (LDC) - L’arginine Di-hydrolase (ADH) - L’ornithine décarboxylase (ODC) - Les catabolites formés après décarboxylation sont: - Ornithine  putrescine - Lysine  cadaverine - Arginine  agmatine  putrescine - La mise en évidence de ces décarboxylase: - 4 bouillons

un dosage colorimétrique, basé sur le changement d'absorbance (la mesure se fait à 595 nm), se manifestant par le changement de la couleur du bleu de Coomassie après liaison (complexification) avec les acides aminées basiques (arginine, histidine, lysine.) et les résidus hydrophobes des acides aminés présents dans la ou les protéines. La forme anionique (liée) du colorant est bleue, et possède un spectre d'absorption maximal estimé historiquement à 595 nm. Les formes cationiques (libres) du colorant

Décarboxylation d’un acide aminé NH2 Décarboxylase R CH COOH R CH NH2 + CO2 Réactions catalysées par les principales décarboxylases LDC Lysine Cadavérine + CO2 ODC Ornithine Putréscine + CO2 ADC Arginine Argmatine + CO2 ADH Arginine Urée + Ornithine Lecture du milieu de Falkow (exemple de la recherche de la LDC) Milieu violet : les bactéries ont dégradées le glucose puis la lysine : LDC + Milieu de Falkow + lysine ensemencé et incubé 24 heures

l'azote du groupement amide de l'asparagine: N-acétylglucosamine Pathologie Lymphomes folliculaires (+) Golgi Gongenital disorders of glycosylation (CDG) (-) Caroline Moyret-Lalle © R polaire chargé positivement: les acides aminés basiques Lysine, Lys, K Possède une fonction amine supplémentaire Arginine, Arg, R Groupement guanidyle HN=C-NH2 Histidine, His, H Possède un cycle imidazole NH3 +—CH  (CH2)4 NH3+ —COO- NH3+—CH —COO(CH2)3 NH C NH2+ NH2 Groupe δ -guanidyle