Peptide signal

Pour cela, nous allons utiliser une approche par similitude. Recherche dans les bases de données de séquences de protéines. Prédiction fonctionnelle par détection de signatures Localisation cellulaire des protéines Recherche de peptide signal Recherche de fragments transmembranaires faire un résumé de toutes les informations.

est dans l’espace périplasmique. Ces résultats montrent que le segment 1 sert de peptide de début de transfert, son extrémité N-terminale faisant face au cytoplasme et son extrémité C-terminale (phosphatase alcaline) dans le périplasme. Les chimères entre les segments 2 et 3 (pasmide 3 et 4) ont une activité faible, indiquant que la phosphatase alcaline est dans le cytoplasme ; le segment 2 doit donc servir de peptide de fin de transfert. Les chimères après le segment 3 ont une activité élevée, indiquant

complexe d’initiation et commence à synthétiser une protéine qui porte à son extrémité amino-terminale un signal peptidique hydrophobe d’adressage au RE. Le signale peptidique est reconnu par une SRP (signal recognition particul). Il s’agit d’un complexe ribonucléoprotéique formé par l’ARN 7S associé à des protéines, et qui fait la navette entre mambrane du RE et le cytoplasme. Il s’associe au signal peptidique dés qu’il émerge de la grande sous-unité. La SRP se fixe alors sur le site A de la grande

Le solvant est composé de butanol Chromatographie par echange d’ions Chromato-liquide Haute pression HPLC Obtention de temps de rétention différent, aire de pic différent. Les peptides I-Les liaisons peptidique Liaison Amides Chaine polypeptidique Nomenclature liaison isopeptidique Peptide cyclique II Determination des sequence ppt I-liaisons peptidique -Liaisons amide Les aa sont liée les uns les autres par une réaction de condensation entre la fonction COOH

plus humaines expriment une surface C-type lectin le récepteur, CD94/NKG2A/B, qui livre un signal inhibiteur aux cellules Nk. Il interagit spécifiquement avec une classe MHC nonclassique I molécule, HLA-E, wich exige bindingof un peptide nonamer tiré de résidus 3 à 11 de l'ordre de signal de la classe MHC la plus classique I molécules pour l'expression superficielle cellulaire. De façon intéressante, ce peptide de leader traité est sorti sur le cytosol et ensuite transporté par PROFITENT de lumen d'EUH

une modification de l’Ag qui sera découpé en petits morceaux qui seront pris en charge par les molécules de CMH. Ce phénomène d’apprêtement va permettre de révéler des épitopes qui étaient cachés. Ce phénomène est nécessaire car en utilisant des peptides de synthèse, on a trouvé que pour un lysozyme, les acides aminés 52 à 61 étaient reconnus par les LT. Ce système de dégradation n’est pas identique si on a affaire à un antigène endogène ou un antigène exogène. 1. Les antigènes endogènes ou cytoplasmiques

RE 2) Adressage 2.1) Séquence signal 2.2) Mécanisme d'entrée en cours de synthèse IV) Modifications post traductionnelles et contrôle de qualité par le RE et le Golgi 1) Formation des ponts disulfure 2) Repliement des protéines 3) Contrôle de qualité 4) Insertion des domaines transmembranaires dans la membrane du REG 5) Glycosylations 5.1) N glycosylations 5.2) O glycosylations 5.3) Rôle des glycosylations V) Mécanismes de translocation de peptides en provenance du protéasome VI)

denses au fàm qu’elles s’éloignent du TGN, déversent leur contenu à l’extérieur de la cellule par exocytose. Exemple ; hormone peptidique ( insuline), grains de zymogène C’est la sécrétion régulée car elle se fait toujours sous l’influence d’un signal reçu par l’extérieur de la cellule. . sécrétion constitutive se fait par les vésicules de transport beaucoup plus petites que les grains de sécrétion , à coatamères, apportent aux reste de la cellule des constituants nécessaire au métabolisme

CMH présentent les peptides aux lymphocytes T V! V" Figure 1bis : le complexe TCR-CD3 (Cours de Janis Kuby Editeur DUNOD) TCR TCR Boucles hypervariables CDR 1 et 2 ! en rose CDR1 et 2 " en bleu CDR3 ! et " en vert CMH-Ipeptide Peptide vert Figure 2 : structure d’un complexe TCR-CMH-I-peptide (Davis et al 1998 Annu Rev Immunol 16: 523) HLA-A2 HLA-A2 HLA-A2 HLA-A2 HLA-A2 HLA-B27 Figure 3 : les TCR sont spécifiques d’un complexe CMH-peptide (Cours de Janis

Rennes Bat 8 - 1er étage Pôle Molécules Service de Génétique Moléculaire et de Génomique Médicale CHU de Rennes - Hôpital Pontchaillou 1 BIOCHIMIE STRUCTURALE: DES AA AUX PROTEINES I. II. III. LES ACIDES AMINES LES PEPTIDES / PROTEINES - STRUCTURES LES PEPTIDES / PROTEINES - FONCTIONS 2 CHAPITRE I: LES AMINO-ACIDES 3 Cation Anion R H CH NH3 COOH pK pK1 C R H CH NH3 + COO - R CH H p K2 pKN COO - NH2 pH alcalin pH acide pKC: Dissociation