Structure secondaire

LES PROTEINES Structure primaire La structure primaire, ou séquence, d'une protéine correspond à la succession linéaire des acides aminés (ou résidus) la constituant sans référence à une configuration spatiale. Les protéines sont donc des polymères d'acides aminés, reliés entre eux par des liaisons peptidiques Polarité, extrémités N- et C-terminales La séquence primaire d'une protéine a un sens bien défini ou polarité. Le premier acide aminé de la séquence de la protéine est par convention

structurales de notre protéine dues à ces mutations. nous allons donc la comparer à une protéine de référence connue dans la banque de donnée PDB, qui est la Retinol-binding Protein 4 (RBP4) dont le code pdb est 3FMZ, nous permettant d’accéder à la structure tridimensionnelle déterminée par cristallographie. I. Comparaison de la séquence étudiée avec une protéine retinol-binding 4 : Cette protéine appartient à la famille de lipocaline et a pour fonction de livrer le rétinol (alcool de Vitamine

1) Un segment protéique unique structuré en hélice alpha et comptant 21 acides aminés hydrophobes est détecté dans une bicouche lipidique avec une orientation perpendiculaire à la surface de la bicouche. Détaillez le calcul pour déduire l’épaissseur de la bicouche lipidique. Si la proline n’est pas présente dans ce segment, combien de liaison hydrogène dénombrera-t-on au niveau de ce segment en hélice alpha ? En quoi la présence d’une proline pourrait moduler cette réponse ? 2) L’ARN

BSF Dichroïsme circulaire permet d’analyser le contenu en structure 2aire Les structures secondaires des protéines ne vont pas absorber de façon identique les lumières polarisées circulairement a gauche et a droite - l’absorption préférentielle de l’une de ces deux polarisations résulte en une déviation de la résultante -cette déviation est appelée dichroïsme circulaire -Au lieu d’1 cercle, le tracé de la résultante entre spirale tournant a droite et spirale tournant a gauche donne une ellipse

TP2 : La structure des protéines 1. La structure primaire La structure primaire, ou séquence, d'une protéine correspond à la succession linéaire des acides aminés (ou résidus) la constituant. 3) Atome : HG1 64 Résidu : THR 4 Atome : HD1 49 Résidu : LEU 3 Atome : HE2 34 Résidu : HIS 2 Atome : CG1 6 Résidu : VAL 1 5) La structure primaire correspond à la séquence des acides aminés d’une protéine. La structure primaire de cette

II) Structure des protéines La structure primaire est une simple chaine linéaire d'acides aminés. Dans la structure secondaire, les acides aminés forment une chaine linéaire en hélice. L'édifice est maintenu par des liaisons hydrogènes et les attractions entre atome. Dans les structures tertiaires,les structures secondaires s'enroulent entre elles et s'interragissent. Dans la structure quaternaire, ce sont les structures tertiaires qui s'associent. Cette structure très enroulée

la GFP. Structure primaire : séquence de 238 acides aminés,dont 34 négatifs et 26 positifs. Poids moléculaire : 26 .886 Da Point isoélectrique théorique : 5.67 Coefficient d’extinction molaire théorique : 22 015 L·mol-1·cm-1 (protéine secrétée) et 21 890 L·mol-1·cm-1 (protéine cytosolique) Instability index: 31.07 (molécule stable) Hydrophobicité : -0.521 (molécule hydrophobe) La structure secondaire est constituée de 11 feuillets β et une hélice α . GFP présente une structure tertiaire

acides aminés (charge, hydrophobicité...) gouvernent la structure de la protéine, globulaire ou fibrillaire, que l'on peut décrire à différents niveaux : • la structure primaire, qui est la séquence linéaire des acides aminés dans la protéine ; • la structure secondaire, qui rend compte de l'organisation de groupes d'acides aminés en éléments structuraux simples : hélices alpha, feuillets et tours beta, autres structures ; • la structure tertiaire, qui correspond au repliement de la protéine

d’acide aminée. Dans sa structure primaire, la protéine est dite dépliée . Dans sa structure secondaire, la chaîne forme une hélice reliant les acides aminées entre eux selon leur charges par des liaisons hydrogènes faibles. Puis, vient la structure tertiaire ou l’hélice se repli sur elle même de manière à ce que la partie hydrophobe de la protéine ne se retrouve pas en contacte avec la solution aqueuse. La structure quaternaire est l’association de 4 protéines de structures tertiaire . Les acides

Objectif du projet : Modéliser les 3 structures proposées avec le programme ETABS, leurs appliquer une charge de vent et exploiter les résultats. L’objectif est de comparer le comportement des différentes structures du point de vue des déplacements et des efforts induits dans les différents éléments de la structure. Hypothèses : Les structures sont en béton ordinaire de résistance spécifiée de 40MPa et ont 20 étages. Le chargement est une pression latérale uniformément distribuée de 2