Biologie moléculaire
PLATEFORME BIO
CIME - nanotech
dans les locaux du BCAi
(Bâtiment des Composants Avancée de l'INP Grenoble)
3, PARVIS LOUIS NEEL
BP 257 / 38016 GRENOBLE Cedex 1
PLAN du TP-TD
Principe :
Il est organisé autour de SNAP, une protéine soluble de Dictyostelium discoideum qui a été étudiée en TD de bioinformatique. On veut faire l’expression du fragment cytoplasmique avec une étiquette His6 dans un vecteur pQE30. Diverses techniques nécessaires au sous-clonage seront abordées :
PCR, digestion par des enzymes de restriction, séparation de fragments d’ADN sur gel d’agarose, culture de bactéries.
La SNAP sera purifiée par chromatographie d’affinité et analysée sur gel d’acrylamide par la méthode SDS-PAGE. Elle sera identifiée par des anticorps spécifiques (techniques de Western blot et d’ELISA).
Concepts clefs et difficultés attendues :
Distinguer techniques acides nucléiques et techniques protéines.
Distinguer séquence codante des autres.
Distinguer vecteurs d’expression et vecteurs de clonage.
Organisation d’un plasmide et étapes d’un sous-clonage : à reconstituer à partir d’éléments épars dans le TP
Bonnes pratiques en biologie : importance des contrôles positifs et négatifs (ex digestion ER)
Sécurité des personnes et de l’environnement.
Evaluation :
Elle se fera sur : le compte-rendu de TP par binôme (résultats des expériences, commentaires, présentation) la participation individuelle au travail en groupe
Le manuel de TP est divisé en deux parties : la première explique le déroulement des expériences (bio1-5), la deuxième donne les explications nécessaires à chaque type d’expérience (p.14).
Nota : les éléments soulignés servent à la préparation du TP et sont donc réalisés par les enseignants.
Organisation du TP
Date
TP
groupe
vendredi 24.10
BIO1
groupe2
vendredi 7.11
BIO1
groupe1
vendredi 14.11
BIO2
groupe1
mardi 18.11