Ecole Doctorale ABIES (Biologie) THÈSE pour obtenir le grade de Docteur de l’Institut National Agronomique Paris-Grignon Discipline : Génétique

présentée par

Thierry DOAN

Etude fonctionnelle du génome de Bacillus subtilis : de nouvelles régulations transcriptionnelles du métabolisme central du carbone.

Soutenue le : 25 avril 2003, devant le jury composé de Pr. Claude Gaillardin Dr. Philippe Glaser Dr. Jorg Stülke Dr. Frédéric Barras Dr. Stéphane Aymerich Président rapporteur rapporteur Examinateur Directeur de thèse

© UMLV

yŒ”Œ™ŠŒ”Œ•›šG yŒ”Œ™ŠŒ”Œ•›šG G j Œ G› ™ ˆ  ˆ  “ Gˆ Gï › ï G™ ï ˆ “  š ï G‹ ˆ • š G“ Œ Gs ˆ ‰ – ™ ˆ › –  ™ Œ G‹ Œ Gn ï • ï ›  ˜ œ Œ Gt– “ ï Š œ “ ˆ  ™ Œ GŒ › Gj Œ “ “ œ “ ˆ  ™ Œ Gæ G{    Œ ™  ˆ “ T n ™  Ž • – • GO p u y h G Gj u y z G Gp u h w Tn P G‹  ™  Ž ï G— ˆ ™ G“ Œ Gw ™ –  Œ š š Œ œ ™ Gj “ ˆ œ ‹ Œ Gn ˆ  “ “ ˆ ™ ‹  • U Gq Œ Gš – œ  ˆ  › Œ G“ œ  G › ï ” –  Ž • Œ ™ G” ˆ GŽ ™ ˆ ›  › œ ‹ Œ U Gq Œ G“ Œ G™ Œ ” Œ ™ Š  Œ Gˆ œ š š  G‹ ˆ  –  ™ Gˆ Š Š Œ — › ï G‹ Œ G— ™ ï š  ‹ Œ ™ G“ Œ G‘ œ ™ G‹ Œ G” ˆ G›  î š Œ U G q Œ G›  Œ • š Gæ G› Œ G™ Œ ” Œ ™ Š  Œ ™ G› ™ î š Gš  • Š î ™ Œ ” Œ • › S Gz › ï —  ˆ • Œ S G‹ Œ G” ˆ  –  ™ Gˆ Š Š œ Œ  “ “  GŒ › G ï ™  › ˆ ‰ “ Œ ” Œ • › Gï “ Œ  ï G O š Š  Œ • ›    ˜ œ Œ ” Œ • › G — ˆ ™ “ ˆ • › GHP G ˆ œ G š Œ  • G ‹ Œ G “ ï ˜ œ  — Œ G iˆŠ““œšG šœ‰ › “šG ‹ œ G “ ˆ ‰ – ™ ˆ › –  ™ Œ U G j Œ “ ˆ G • ˆ G Š Œ ™ › ˆ  • Œ ” Œ • › G— ˆ š Gï › ï G ˆ Š  “ Œ Gˆ œ G‹ ï ‰ œ › S G” –  G˜ œ  G• ˆ  ˆ  š G” ð ” Œ G— ˆ š GŠ – œ “ ï Gœ • Œ Gš Œ œ “ Œ G‰ – ô › Œ G‹ Œ Gw ï › ™  G ˆ œ — ˆ ™ ˆ  ˆ • › GHG q Œ G š œ  š G › ™ î š G  – • – ™ ï S G tU G n “ ˆ š Œ ™ S G tU G z › “ ’ Œ G Œ › G tU G i ˆ ™ ™ ˆ š S G ˜ œ Œ G  – œ š G ˆ Œ ¡ G ˆ Š Š Œ — › ï š G ‹ ™ ˆ — — – ™ › Œ œ ™ š GŒ › GŒ Ÿ ˆ ”  • ˆ › Œ œ ™ G‹ Œ GŠ Œ › › Œ G›  î š Œ U GG q Œ G™ Œ ” Œ ™ Š  Œ Gn Œ – ™ Ž Go – ” œ ›  GŒ › Gt Š  ˆ Œ “ Go Œ Š ’ Œ ™ G— – œ ™ G“ Œ GŠ  ˆ “ Œ œ ™ Œ œ Ÿ Gˆ Š Š œ Œ  “ G˜ œ —