M1 NMS. 2013-2014

Edifices biomoléculaires pour les nanosciences
UFR de Chimie
UE4
Modélisation des biomolécules
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Compte rendu

Visualisation et analyses structurales des macromolécules biologiques

AIT TOUCHENTE Zouhair
DAROUECHI ali abdallah

Encadrant : Florent BARBAULT

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INTRODUCTION
L'ADN est composé de deux brins se faisant face, et formant une double hélice. Ceci est possible car les nucléotides trouvés dans un brin possèdent des nucléotides complémentaires avec lesquels ils peuvent interagir par des liaisons hydrogène (liaisons faibles) .
Le But de ce TP est observer les structures biologiques et des protéines. Pour aboutir ce travail, nous allons utilisés le logiciel Viewerlite qui permet de calculer et d’identifier les structures de l’ADN.

1ère partie, acide nucléique:

Fig.1. ADN-B
On peut représenter L’ADN-B en vue aérienne, par l’absence de vide sur son hélice, cette structure permet de différentier les différents formes de L’ADN.L’ADN-A est plus court et plus large, par contre L’ADN-B a un double hélice gauche dont le squelette présente une conformation de structure zigzag. La forme DNB est la plus stable et la plus solide.

on peut visualiser les sillons sur la fig.2. avec les bases azotées de couleurs différents :
Bleu : thymine violet : cytosine vert : guanine rouge : Adénine fig.2. Répresentation des bases

2

5'-ATTGCCGTATGTATTGCGCT-3'
3'-TAACGGCATACATAACGCGA-5'
Les deux brins antiparallèles d'ADN sont toujours étroitement reliés entre eux par des liaisons hydrogène (également appelées « ponts hydrogène » ou encore simplement « liaisons H » ou
« ponts H ») formées entre les bases complémentaires A-T et G-C. Ces deux brins d'ADN sont dits complémentaires car les purines (adénine et guanine) d'un brin font toujours face à des pyrimidines de l'autre brin (thymine et cytosine).
Le logiciel permet aussi de visualiser la distance des liaisons hydrogènes formées par les bases pyrimidiques