UE1. Biochimie.

Biochimie Structurale: Etude de la structure et des propriétés des biomolécules intervenant dans la cellule.

Biochimie Métabolique: Etude des mécanismes dynamiques de transformation et d'échanges entre les biomolécules dans la cellule.

Les Biomolécules:
- Les protéines: AA, peptides et protéines
- Les lipides: les acides grans
- Les glucides: oses simples, oses complexes
- Les stéroïdes

Chapitre 1: Les Acides Aminés (AA)

I. Généralités

Les AA: élément de base des protéines

- Les AA sont les éléments de base des protéines: les protéines sont construites à partir d'un répertoire de 20 AA courants et 2 AA rares.

- Les cellules synthétisent leurs protéines à partir de 22 AA:
AA courants (20)
AA rares (2)

- Une séquence de 150 AA ➔
150^20 protéines différentes.

- Les AA sont à la source de la diversité des séquences de protéines, et par conséquent, de leur forme, et de leur fonction.

Les acides alpha-aminés

- Chaque acide alpha-aminé possède: un groupement amine primaire porté par le carbone alpha un groupement acide carboxylique porté par le carbone alpha une chaîne latérale R dont la nature différencie les AA entre eux.

- Ils différent entre eux par la nature chimique du radical R qui constitue la chaine latérale ou chaine radicalaire.

- La masse moléculaire moyenne d'un AA est de 110 Da. ✎

La chaine latérale R est variable
- Taille
- Charge
- Polarité
- Hydrophobicité
- Réactivité chimique
- Aliphatique (chaîne ouverte) ou aromatique (chaîne fermée)

Nous allons effectuer une classification selon la polarité des AA.

Nomenclature des AA:
Nom Alanine
Code à 3 lettres Ala
Code à 1 lettre A

II. Les différents AA

1- Les AA courants

Classification en fonction de R:

- AA avec R polaire (hydrophobes)
- AA avec R polaire non chargé (hydrophiles)
- AA avec R polaire basique chargé + (basiques)
- AA avec R polaire acide chargé - (acides)