Acide aminé

Biochimie Cours 1 SOMMAIRE Classification  Généralité  Structure des peptides -type de peptide -liaison peptidique - Convention d’ écriture  Propriétés peptides  2 CLASSIFICATION Molécules Molécules non non hydrolisables hydrolisables Acide Acide aminés aminés (( sous sous unités) unités) Oligopeptides Oligopeptides (( 2 2à à 10 10 AA) AA) Protides Protides Peptides Peptides (( 2 2à à 100 100 AA) AA) Polypeptides Polypeptides (( 10 10 à à 100 100 AA) AA) Molécule Molécule hydrolisables

essentiellement plane, 6 atomes, presque toutes Trans + courte que la liaison covalente important caractère de double liaison → empêche libre rotation ce caractère renforcé par longueur de la liaison entre groupes CO et NH Chaine peptidique résidu = acide aminé 2 résidus = dipeptide / 3 résidus = tripeptide Chaine carbonée : partie régulière : chaine principale ou squelette partie variable : chaines latérales spécifiques liaisons croisées = ponts dissulfures (souvent dans p! Extracellulaires,

plusieurs acides aminé ensemble. . On parle généralement de protéine lorsque plus de 100 acides aminés sont liés au sein d'une chaîne.  Les acides aminés sont les éléments constitutifs des protéines, et du muscle. Tous les acides aminés ne sont pas égaux. Certains ont des propriétés uniques qui représentent un intérêt particulier pour les pratiquants de la musculation et d’autres aides à la réparation de tissue et à leurs fabrications. La dégradation de la protéine crée plusieurs acide aminés et aide

par catégorie. b. fichier traité par le script perl, affichant le taux relatif d’évolution des sites protéiques. (Wei Chen, minor thesis, 2014) Figure 4 : Fichier Excel présentant le taux d’évolution du génome ainsi que le pourcentage de chaque acide aminé. (Source personnelle) Figure 5 : Base de données utilisée pour stocker les informations relatives aux extrêmophiles. (Source personnelle) Figure 6 : Interface du logiciel. (Source personnelle) Page web du logiciel 1. Envoi des données au fichier

séquences d’acides aminés des différentes protéines avec le logiciel Anagène Utilisez les fonctionnalités du logiciel Anagène (voir fiche aide) pour compléter le tableau suivant représentant le pourcentage de ressemblance entre les séquences d’acides aminées des 3 hormones comparées deux à deux. Vous utiliserez les fichiers GH.pro ; HLP.pro et HPRL.pro situés dans « Banques de séquences », « Séquences fournies », « hormones hypophysaires et placentaires ». Pour les comparaisons utiliser « comparaison

protidiques I/ Caractéristiques des acides aminés Les acides aminés constituent les unités monomériques des protéines les acides aminés  Sont bi fonctionnels Il Porte sur le carbone centrale ( carbone α )  Une Fonction carboxylique  Une Fonction amine O C O carbone α H3N C R H  Se différencient par une partie variable  Radical ou Chaîne latérale 1.2/ Classifications Classification structural : Radical Cyclique /Aliphatique Radical Aliphatique Radical Cyclique Classification

lien entre les différentes échelles du phénotype On cherche à comprendre le lien (relation scause conséquence) entre le phénotype moléculaire et le phénotype macroscopique c'est à dire qu'on cherche à comprendre ce qu'implique le changement d'un acide aminé en position 6 dans la chaine b de l'hémoglobine. On peut visualiser la structure tridimensionnelle de la chaine b de l'Hb grâce au logiciel Rastop (fichier Hbn càd Hb normale): 1. Visualisation de la molécule d'hémoglobine. (pour se favoriser

GLUCAGON. plus ce taux est elevee plus il y a d insuline liberee plus ce taux est bas, plus le glucagon liberre est grand TRYPSINE: La trypsine est une endoprotéase qui hydrolyse les liaisons peptidiques dans lesquelles un acide aminé basique (Lys, Arg) engage sa fonction acide. La trypsine est une enzyme du suc pancréatique. Elle est synthétisée sous forme de trypsinogène (proenzyme inactive) puis stockée dans les vésicules enzymatiques des cellules acineuses, d’où elle est excrétée au moment de

représente environ 40% des caséines. Elle est composée de 209 acides aminés et a une masse moléculaire d'environ 24kDa. Cette molécule est insoluble à cause d'une importante zone hydrophobe dans sa séquence en acides aminés. La tyrosine est un acide aminé aromatique et polaire. La tyrosine est indispensable dans certains métabolismes comme la synthèse des catécholamines, la formation de la mélanine ou des hormones thyroïdiennes. Cependant elle ne fait pas partie des 9 acides aminés indispensables

le kwashiorkor et le marasme (carence en calories). Mais il existe différentes carences comme : ✓ La carence en lipides : retentie sur le développement du système nerveux, le comportement sensoriel et psychomoteur. ✓ La carence en vitamines C (acide ascorbique) : entraîne le scorbut, se manifeste par l’anomalie de la coagulation de sang et par une atteinte de la gencive provoquant une chute des dents. ✓ La carence en vitamine PP (la pellagre) : caractérisée par le système des 3D _dermatose