Protéome

séquençage au Genopôle d’Évry Ere Post-Génomique Identification des fonctions biologiques codées par les gènes Identification de nouvelles cibles thérapeutiques Génotype Phénotype ADN ARN messagers Transcriptome Protéines Protéome Variations qualitatives et quantitatives du transcriptome cellulaire spécification tissulaire stress traitement pharmacologique état pathologique dynamique biologique mRNA X1 AAAA AAAA AAAA AAAA AAAA AAAA AAAA AAAA mRNA X4 mRNA X2

quelques minutes à quelques jours, avec pour la grande majorité des ARNm une durée de vie de quelques heures. C'est grâce à l'épissage alternatif que l'on peut expliquer que si l'homme possède 30 000 gènes (50 000 pour un grain de riz), la taille de son protéome, c'est à dire l'ensemble des protéines, est infiniment plus grande. Schéma épissage alternatif La transformation de cet ARN messager en protéine se fera grâce à une étape appelée traduction, qui se déroule dans le cytoplasme. Schéma

s'il a une fonction connue. La seule fonction connue est de servir de modèle à un ARN. Il existe de nombreux ARN dont les ARNm qui vont être traduits en protéines. Les gènes moléculaires formant le protéome, sont des séquences d'ADN utilisées pour la synthèse de protéines. Les gènes moléculaires du protéome forment une information génétique protéique. Les éléments cellulaires non génétiques constituent une information cytoplasmique. Les protéines sont alors le résultat de mécanismes que l'on regroupe

cytoplasme. Les ribosomes associent chaque acide aminé à la chaine polypeptidique en cours de formation en fonction du codon correspondant. Les protéines vont ensuite être terminées dans l'appareil de golgi pour être fonctionnelles. C. DU GENOME AU PROTEOME OU EPISSAGE ALTERNATIF TP5 1. Les gènes des eucaryotes sont morcelés Les gènes sont constitués d'exons(séquences transcrites et codant pour la chaine de protéine) et d'introns (séquences non traduites). Lors de la transcription, toutes les séquences

LA MATURATION DE L’ARN. Introduction : Le génome humain comporte 20 à 25 000 gènes « seulement » mais le protéome (l’ensemble des protéines produites) est lui beaucoup plus important. Des mécanismes de maturation de l’ARN peuvent être à l’origine d’une diversification des protéines formées. A partir de l’étude de documents, nous allons expliquer sous la forme d’un schéma bilan les transformations subies par l’ARN messager et leurs conséquences sur les protéines formées. Document 1 : Le document

Enzymologie 1- Généralités à propos des enzymes a) Nature chimique et origine Placement des atomes qui répond à un programme précis : le programme génétique x Enzyme= struct moléculaire retrouvée dans les struct spécialisée=> structure tertiaire -> confère une fonction Donc lien structure/fonction x Les enzymes sont des polypeptides ou protéines (et quelque fois des ARN = ribozymes) x Toutes les chaînes polypeptidiques des protéines sont élaborées à partir des mêmes 20 acides aminés standards

fonctionnelle. ILS OFFRENT : UniProtKB | Protéines de connaissances, se compose de deux sections: *  Swiss-Prot, qui est manuellement annotées et évaluées. * TrEMBL, qui est automatiquement annotée et pasexaminés.Inclut complets et ensembles protéome de référence . | UniRef | Groupes de séquences, utilisés pour accélérer les recherches de similarité de séquence. | Uniparc | Archive séquence, utilisé pour garder une trace des séquences et leurs identificateurs. | * InterPro - signatures

à raisonner le choix de caractères phénotypiques pertinents, en prenant en compte le cas échéant les phénomènes de compétition, et les effets de sélection sur plusieurs générations. D’autre part, les études d’expression massives (transcriptome, protéome, métabolome) vont permettre une description intégrée et précise des réseaux géniques et métaboliques affectés par le polymorphisme d’un gène donné, ou par la variation d’un facteur de milieu donné. La modélisation est ici indispensable pour

et secs et diffusion de supports d'actions commerciales auprès de ses clients (3000m², 2.5M€, prêt septembre 2009). L'année suivante il est prévu la construction d'une usine de 5000m² pour développer la production de cuits et précuits. 3338 Le protéome de la levure de boulanger déchiffré. 12-nov-08 Des chercheurs de l'institut Max Planck de biochimie de Martinsried près de Munich ont identifié 4399 protéines présentes chez la levure de boulanger et ont montré les manières dont le jeu de protéines

identification des gènes, des séq régulatrices, des séq répétés La génomique fonctionnelle Etudie la ft des gènes , leurs régulations et leurs produits : Σ d’ARNm présents dans une ₵ dans des conditions définies = Transcriptome Σ de protéines = protéome La génomique comparative Compare les seq de différents génomes pour comprendre leur lien fonctionnel Bioinformatique C'est au début des années 80 que les premières banques de séquences sont apparues. Grâce à un accord international, 3 groupes collaborent