Repliement des protéines

alternatifs sont dus à la modification d’une protéine, d’origine génétique. Les protéines des êtres vivants sont constituées d’acides aminés (20 sortes) qui diffèrent par leur radical R. La liaison peptidique est la liaison entre deux acides aminés. On appelle polypeptide une « petite protéine » (moins de 50 acides aminés) Organisation spatiale des protéines - Structure primaire : C’est la séquence des acides aminés qui constituent la protéine sont qui reliés entre eux par des liaisons peptidiques

PROTIDES Introduction ✗ ✗ ✗ Le terme protide regroupe AA + peptides + protéines Les AA sont les molécules de base des protéines 200 AA connus mais seulement 20 constituent nos protéines ✔ Peptides : association covalente de plusieurs AA reliés les uns aux autres par des liaisons peptidiques ✔ Oligopeptides : 2 à 10 AA ✔ Polypeptides : plus de 10 AA ✔ Protéines : Plus de 100 AA On distingue dans les protéines : – Les Holoprotéines : que des AA – Les Hétéroprotéines : AA + glycane

rksistance h la traction. En combinant les motifs prote’iques qui les composent avec des se’quences provenant d’autres mole’cules, la biotechnologie permet dksormais de cre’er des biomate’riaux ikdits. * Unite de biochimie et de technoloQie des proteines, Inra, rue de la GBraudilrre, 6.P 1627, 44316 Nantes cedex 03. + Division of Chemistry and Chemical Engineering 210-41, California Institute of Technology, Pasadena, CA 91125. itats-Unis. (1) D.A. Tirrell (1996) 39-40. Science 271, rganes

Elle représente en effet un outil particulièrement indispensable à l’étude de la structure des biomolécules et des protéines, dont la connaissance est impérative à une bonne compréhension de leur fonction. Elle permettra d’ailleurs par la suite la proposition d’éventuelles solutions thérapeutiques, puisque la quasi-totalité des pathologies sont dues à des disfonctionnement des protéines et des altérations de leur structure [2]. Aperçu historique Même si les premiers travaux faisant allusion à la

en ont deux et la glycine qui n’en possède pas). Chaque acide aminé est classé dans le système R/S : tous les acides aminés sont de la série S, sauf la cystéine qui est de la série R. Cas particulier : 2S 3R T et 2S 3S I Isomère L : (dans les protéines) Isomère D : Chaque acide aminé dévie le plan de polarisation : de façon lévogyre (à gauche) et de façon dextrogyre (à droite). Les propriétés physico-chimiques : Les propriétés ioniques : Chaque acide aminé libre

Cellule T effectrice + Cellule T à mémoireCTL + Th2) Immunogénicité et antigénicitéAnticorpsEn expérimentation:On a tendance à utiliser les protéines et les polysaccharides comme immunogènes dans la plupart des études expérimentales de l’immunité humorale. Pour l’immunité à médiation cellulaire, seules les protéines et certains lipides ou glycolipides servent d’immunogènes .Antigénicité L’Antigénicité est la capacité à se combiner spécifiquement avec les produits finals des

quelque micron (mm.) Elles sont souvent entourées d’une coque protectrice, la paroi, sous laquelle se trouve la membrane plasmique qui délimité le cytoplasme qui est un compartiment interne unique. Dans le cytoplasme se trouve l’ADN, l’ARN, les protéines et d’autres petites molécules : toutes les molécules nécessaires à la cellule. Par microscopie électronique, le cytoplasme apparaît comme une matrice de texture variable sans aucune structure interne organisée évidente. (figure I3 b) Les bactéries

méthodes de recherche de signatures pondérées par la fréquence des positions VRAI 1. Les acides aminés d'un site actif sont toujours dans le même ordre dans les séquences FAUX 2. La E() value est toujours inférieure à 1 FAUX 3. Deux protéines de repliements différents peuvent avoir le même site actif VRAI 4. Il peut y avoir des molécules d'eau associées à la structure VRAI 5. La notion de sites fait appel à la structure tertiaire VRAI 6. Il existe des méthodes de recherche de signatures

Biochimie des protéines Introduction Les protides sont un des constituant de la matière vivante. Dans toutes les cellules, il y a des groupes de substances Dites organiques azotées divisés en trois : Les acides aminés (20 + 2) Les peptides : enchaînements à 2 à 100 aminoacides reliés par des liaisons peptidiques. Les protéines : Polypeptides de plus de 100 acides aminés. → plusieurs milliers. Assument des fonctions essentielles dans la fonction du vivant : * métabolisme

I. LES PROTÉINES À L’ ORIGINE DES CARACTÈRES PHÉNOTYPIQUES A. Phénotypes et niveaux d’ organisation du vivant B. Enzymes et catalyse enzymatique 1. Les enzymes : des catalyseurs biologiques 2. La double spécificité des enzymes 3. L’ influence des conditions du milieu sur la catalyse enzymatique 4. La formation du complexe enzyme-substrat 5. Importance de la structure tridimensionnelle pour l’ activité enzymatique II. LA SYNTHÈSE DES PROTÉINES A. Information génétique et protéines 1. L’ ADN