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Analyses statistiques de base avec rcmdr comme rcm

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Analyses statistiques de base avec R et Rcmdr comme interface graphique Christian Jost - Biologie Santé - UE 3M7BS15M - 2010/11
Ce polycopié a été développé en 2009 pour une introduction aux statistiques de base
(Chi-2, tests à un, deux ou plusieurs échantillons) en 4 TP de 2h, à l’aide de R 2.9.2 et
R-commander 1.5-3. Attention, R-commander évolue rapidement, des versions antérieures ne correspondent pas toujours aux indications dans ce polycopié.
Pour l’organisation des données les …afficher plus de contenu…

Cliquez dans Rcmdr sur le menu Fichier
-> Changer le répertoire de travail et sélectionnez ce répertoire.
Maintenant on est prêt à charger les données. Cliquez sur Données -> Importer des données -> depuis un fichier texte .... Vous verrez la fenêtre Fig 1.2 : donnez un nom au tableau à importer
(par exemple moutons) et vérifiez que la case Noms de variables dans le fichier est coché (c’est comme ça qu’on a préparé les données, la première ligne contient les noms des colonnes). Un aspect très important est la case Séparateur décimal - Virgule : votre tableur fonctionne avec des virgules décimales (comme il est d’usage en France et dans quelques autres pays), mais un logiciel …afficher plus de contenu…

La représentation graphique de durées d’évènements a été bien étudiée dans le contexte des études cliniques (temps avant guérison, temps avant rechute, temps avant la mort) et un des outils qui a émergé est l’analyse de survie. Dans une telle analyse chaque temps de transport représente un évènement. Pour tracer une courbe de survie on les fait tous commencer au même moment et ensuite on trace le nombre d’événements qui durent encore au cours du temps. Dans notre exemple on trace le nombre de fourmis qui transportent encore au cours de temps, et à chaque fois qu’une fourmi dépose son cadavre ce nombre est diminué par un. Par exemple, le temps le plus court est 9, donc jusqu’à t = 9 il y a 71 fourmis

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