Compte-rendu du polymorphisme des génomes nucléaires et mitochondrial
Emma BERNARD Compte-rendu Analyse du polymorphisme des génomes nucléaire et mitochondrial
Introduction Le polymorphisme correspond à la coexistence de plusieurs allèles pour un gène ou locus donné chez un individu pouvant appartenir ou non à la même espèce. Il permet d’observer les éventuelles mutations apparues sur un gène au cours de l’évolution chez deux espèces. Le génome mitochondrial contenu dans …afficher plus de contenu…
Le génome nucléaire contenu dans le noyau de la cellule se trouve sous forme de chromosomes linéaires dans celle-ci. La moitié du génome nucléaire d’un individu provient de la mère et l’autre moitié provient du père.
L’objectif de ce TP est d’étudier le polymorphisme du gène nucléaire (28S) codant un ribozyme et celui du gène mitochondrial de la cytochrome oxydase I (COI) chez 2 espèces d’invertébrés C.gigas
(huître creuse) et M.edulis (moule bleue).
Matériels et méthodes synoptiques en annexe 1. Extraction de l’ADN La première étape de l’extraction de l’ADN s’effectue par une lyse cellulaire en présence de …afficher plus de contenu…
2. Contrôle de la qualité de l’ADN
Il est nécessaire de mesurer la qualité de nos extraits d’ADN pour vérifier qu’ils soient bien purs, et qu’il n’y ait plus de contaminants. Pour ce faire nous mesurons la densité optique de ceux-ci à
230/260 nm et à 260/280 nm. Si le rapport DO 230nm /DO 260nm est compris entre 2 et 2,2 nos extraits seront considérés comme purs, de même pour DO 260nm /DO 280nm qui doit être compris entre 1,8 et 2,0.
3. Amplification (PCR)
Le but de cette manipulation par PCR est d’effectuer une amplification enzymatique d’une séquence d’ADN afin d’obtenir une quantité suffisante de la séquence à étudier par l’obtention d’un très