Evaluer le lien statistique entre concentration de spores de botrytis cinerea dans l’air, variables climatiques locales et mouvements des masses d’air
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Evaluer le lien statistique entre concentration de spores de Botrytis cinerea dans l’air, variables climatiques locales et mouvements des masses d’airSommaire Table des figures 1 Introduction 3 I) Institut national de la recherche agronomique 4 1.1) L’Institut 4 1.2) Le centre de recherche INRA PACA 4 1.3) Unité de Biostatistique et Processus Spatiaux 5 II) Matériels 6 2.1) Botrytis Cinerea 6 2.2) Base de données 7 2.2.1) Plateforme Climatik : données météorologiques locales 7 2.2.2) Plateforme ARL : les masses d’air 8 III) Méthodologie 9 3.1) Logique suivie 9 3.2) Analyse en Composantes Principales 9 3.2.1) Objectifs 9 3.2.2) Tableau de données et résumés numériques 10 3.2.3) Espaces associés 11 3.2.4) Construction de l’ACP 12 3.2.5) Conclusion de l’ACP 13 3.3) Régression GLM 13 3.3.1) Principe général 13 3.3.2) Construction du GLM 14 3.3.3) Modèles utilisés 15 3.4) Régression PLS 16 3.4.1) Principe 16 3.4.2) Modèle PLS1 17 3.4.3) Conclusion PLS 17 3.5) Extension de la PLS au cadre du modèle linéaire généralisée 18 3.6) Critère de qualité du modèle et sélection de variables 18 3.6.1) Critère de qualité du modèle 18 3.6.2) Sélection de variables 18 3.6.3) Choix du nombre H de composantes pour la régression PLS 19 IV) Résultats obtenus 20 4.1) Dynamique du nombre de souches de Botrytis cinerea 20 4.2) Analyse en composantes principales 21 4.2.1) Climatik 21 4.2.2) Hysplit 22 4.2.3) Problème de colinéarité 24 4.3) Résultats des modélisations 24 4.3.1) Modèles linéaires généralisés 24 4.3.2) PLS-GLM 27 4.4) Transformation de variables 29 V) Résumé, Discussions et conclusions 31 5.1) Modélisation GLM 31 5.2) Modélisation PLS-GLM 32 5.3) Une perspective prometteuse : l’intégration de facteurs de provenance plus précis 33 5.4) Conclusion générale 36 Bibliographie 37 Annexes 38
Table des figures Figure 1: Entrée