L'image des chromosomes géants de la larve femelle (3ème stade) de Drosophile montre bien le chromosome X ou I (un seul bras), les chromosomes II (bras R et L) III (bras R et L). Ils sont réunis par leurs régions centromériques au niveau du chromocentre. Ici, le petit chromosome IV n'est pas clairement repérable.
La taille exceptionnelle de ces chromosomes, extraits d'une cellule diploïde, est due d'une part au phénomène de polyténie (épaisseur) et d'autre part au fait qu'ils sont peu condensés (longueur).Ils sont environ 100 à 200 fois plus longs que les mêmes chromosomes en métaphase de mitose.
La polyténie se développe surtout au cours du 3ème stade larvaire. Les chromosomes homologues restent appariés et il y a plusieurs cycles de réplication de l'ADN pour chacun d'entre eux, sans cytodiérèse.Dans les cellules des glandes salivaires il y a en général 9 cycles (parfois 10) ce qui conduit à un assemblage de 1024 nucléofilaments disposés parallèlement.
La traction exercée sur la lamelle a provoqué ici la séparation partielle des homologues du bras 2L.
Les chromosomes polyténiques présentent une alternance de bandes sombres et d'interbandes claires caractéristiques bien mises en évidence ici par la coloration. En réalité,on peut les observer sans aucun traitement préalable.
Les "boursouflures" au niveau desquelles les bandes apparaissent hypertrophiées et diffuses sont des puffs. L'un d'entre-eux est bien visible au "début" du chromosome X.Ces puffs sont des sites où les fibres d'ADN sont déployées, ils correspondent à des zones actives de transcription de gènes en relation avec le stade du développement