Synthèse peptidique
- protection - déprotection - activation - application à la synthèse de Gly-Ala -

UdPPC -Tarbes - 12 déc 2012 - André GILLES

Peptides
Un peptide est une molécule constituée d'acides aminés enchaînés par un lien peptidique (amide).
Par convention, on place à gauche l'acide aminé N terminal et à droite l'acide C terminal :
R'

H
COO-

N
H3N+

C
O

Acide aminé NH3+ terminal

R

liaison
Acide aminé COO- terminal peptidique UdPPC -Tarbes - 12 déc 2012 - André GILLES

• Gly-Ala et Ala-Gly sont donc différents
Ala-Gly

Gly-Ala

N
H3N+

COO-

C
O

H

CH3

H

N
H3N+

CH3

COO-

C
O

• Avec 2 AA (chauffage et deshydratation)  4 dipeptides possibles + 9 tripeptides + x tétra+ etc… UdPPC -Tarbes - 12 déc 2012 - André GILLES

Stratégie de synthèse
• Pour former un seul dipeptide, il faut éviter les réactions non désirées et donc bloquer certaines fonctions de manière réversible.
• Il faut aussi rendre plus réactives les fonctions qui doivent réagir.

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1ère étape : la protection
• Pour bloquer une fonction amine, on utilise un groupe « Protecteur d’amine » (Pam)
Pam + H3N+-CHR-COO- Pam-NH-CHR-COOH

• Pour bloquer une fonction acide, on utilise un groupe « Protecteur d’acide » (Pac)
H3N+-CHR’-COO- + Pac  H2N-CHR’-CO-Pac
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2ème étape : l’activation
• Pam-NH-CHR-COOH + H2N-CHR’-CO-Pac 

rien à une température qui respecte le reste des structures pour des raisons thermodynamiques (DrG >0) et cinétiques

activation nécessaire par un « activateur »
(Act) qui agit sur le groupe acide :
• Pam-NH-CHR-COOH + Act 
Pam-NH-CHR-COO-Act
• L’ activateur Act n’est pas un catalyseur ; il est consommé mole à mole et ne sera pas régénéré.
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Enfin (!) la réaction
Pam-NH-CHR-COO-Act + H2N-CHR’-CO-Pac 
Pam-NH-CHR-COO-NH-CHR’-CO-Pac
+