http://www.eao.chups.jussieu.fr/polys/viro/poly/viro.pdf

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Des mutations aléatoires fréquentes

Chez les VIH, le taux de mutations est très important : plus de mille fois plus important que dans le génome d'un humain. En voici les raisons :

la transcriptase inverse - qui permet au VIH de se répliquer - est une enzyme ne possédant pas de mécanisme de détection des erreurs de transcription. Les erreurs sont donc fréquentes et ont été estimées à une tous les 1 700 à 10 000 nucléotides produits. Comme le génome du VIH est composé d'un peu moins de 10 000 nucléotides, il y a approximativement entre une et 10 mutations à chaque cycle viral le nombre important de virions produits, qui est de l'ordre de 10 000 par jour pour chaque virion infectant une cellule. Au sein de l'organisme entier, tous les deux jours, de 109 à 1010 virions sont renouvelés. En théorie, on peut donc prévoir que chacun de ces nouveaux virions porte des mutations différentes.

Ainsi, dans un seul organisme infecté, il y a déjà plusieurs variantes génétiques, représentant ainsi une quasi-espèce virale.

La variabilité du génome viral n'est pas la même pour tous les gènes, certains sont plus enclins à varier que d'autres. C'est ainsi que le gène env est le plus variable (c'est justement lui qui code les protéines de surface gp41 et gp120), alors que le gène pol est le plus conservé

DOCUMENTS:

The accuracy of reverse transcriptase from HIV-1.

Roberts JD, Bebenek K, Kunkel TA.

Laboratory of Molecular Genetics, National Institute of Environmental Health Sciences, Research Triangle Park, NC 27709.

A study was conducted to determine the fidelity of DNA synthesis catalyzed in vitro by the reverse transcriptase from a human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1). Like other retroviral reverse transcriptases, the HIV-1 enzyme does not correct errors by exonucleolytic proofreading. Measurements with M13mp2-based fidelity assays