LES PROTIDES
Introduction
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Le terme protide regroupe AA + peptides + protéines
Les AA sont les molécules de base des protéines
200 AA connus mais seulement 20 constituent nos protéines

✔ Peptides : association covalente de plusieurs AA reliés les uns aux autres par des liaisons peptidiques
✔ Oligopeptides : 2 à 10 AA
✔ Polypeptides : plus de 10 AA
✔ Protéines : Plus de 100 AA

On distingue dans les protéines :
– Les Holoprotéines : que des AA
– Les Hétéroprotéines : AA + glycane

Chapitre 1 : Les acides aminés
I – Nomenclature et classification des acides aminés

Parmi les 20 AA, 19 ont la structure suivante :

En fonction du pH :
– La fonction carboxyle peut se ioniser → COO– La fonction NH2 peut se ioniser → NH3+
Certains AA sont ionisés car ils possèdent un groupement ionisable dans la chaîne latérale
Si R différent de H → C*, on peut avoir alors des stéréoisomères :

La série de l'AA dépend de la position de la fonction amine :
– A gauche → Série L
– A droite → Série D
La plupart des AA naturels sont de la série L mais dans des peptides bactériens, on peut trouver des série D
Nomenclature grec :

Classification :
➢ Selon la nature chimique du groupement de la chaîne latérale
 AA aliphatiques : R = chaîne carbonée plus ou moins longue, linéaire ou branchée qui correspond aux AA suivants → Alanine, Valine, Leucine, Isoleucine
 AA hydroxylés (OH) : Sérine et Thréonine
 AA soufrés : Méthionine et Cystéine
 AA acides : COOH → COO- (ionisable) qui correspond aux AA suivants → Acide glutamique et l'Acide aspartique
 AA basiques : Lysine, Arginine (groupement guanidyl) et l'Histidine (ionisables)
 AA de type amide : groupement CO -NH2 → Glutamine et Asparagine
 AA aromatiques et hétérocyclique : Noyau phényl → Phénylalanine. Noyau indol →
Tryptophane. Noyau phénol → Tyrosine. Noyau imidazole → Histidine

➢ Selon leur caractère hydrophile (polaire) ou hydrophobe (apolaire)
Hydrophile :
 Groupements