Alignement de 2 séquences

3472 mots 14 pages
Alignement de 2 séquences Programmation dynamique

Licence Biologie – L3 BioCell (2010-2011): Analyse in silico de séquences – Emmanuel Talla, Aix Marseille

Homologie

Licence Biologie – L3 BioCell (2010-2011): Analyse in silico de séquences – Emmanuel Talla, Aix Marseille

Homologie
Gène ancestral

Gène A

homologue

Gène B

Spéciation Gène C Gène D Gène E

Duplication Gène F

orthologues

paralogues

CSR - Réunion du 18 juin 2001 / example.ppt 3

2 séquences sont homologues, ou ne le sont pas...

Licence Biologie – L3 BioCell (2010-2011): Analyse in silico de séquences – Emmanuel Talla, Aix Marseille

Similarité de séquence, homologie et alignements de séquences Rechercher des homologues

=
Rechercher des séquences similaires grâce aux alignements de séquences
Licence Biologie – L3 BioCell (2010-2011): Analyse in silico de séquences – Emmanuel Talla, Aix Marseille

Alignements de séquences

Licence Biologie – L3 BioCell (2010-2011): Analyse in silico de séquences – Emmanuel Talla, Aix Marseille

Quand 2 séquences sont-elles considérées comme homologues?

Licence Biologie – L3 BioCell (2010-2011): Analyse in silico de séquences – Emmanuel Talla, Aix Marseille

Construire des alignements de séquences

Licence Biologie – L3 BioCell (2010-2011): Analyse in silico de séquences – Emmanuel Talla, Aix Marseille

Construire des alignements de séquences

Licence Biologie – L3 BioCell (2010-2011): Analyse in silico de séquences – Emmanuel Talla, Aix Marseille

Construire des alignements de séquences

Licence Biologie – L3 BioCell (2010-2011): Analyse in silico de séquences – Emmanuel Talla, Aix Marseille

-Trop long (croissance exponentielle du nombre d'alignements possibles) -Tres peu efficace (recalcul des mêmes valeurs)
Licence Biologie – L3 BioCell (2010-2011): Analyse in silico de séquences – Emmanuel Talla, Aix Marseille

Licence Biologie – L3 BioCell (2010-2011): Analyse in silico de séquences –

en relation

  • Blast et la recherche dans les bases de donnée
    1778 mots | 8 pages
  • Blast
    2398 mots | 10 pages
  • alignement stratégique
    7409 mots | 30 pages
  • Introduction IBI
    4302 mots | 18 pages
  • famille multigenique
    776 mots | 4 pages
  • La biodiversité
    411 mots | 2 pages
  • 14 ECE 06 SUJET
    1489 mots | 6 pages
  • Tp bioinformatique
    653 mots | 3 pages
  • Analyse fonctionnelle d’une famille de protéine : la sous-unité alpha du facteur de fragmentation de l’ADN
    1123 mots | 5 pages
  • Tutorat UE2 2014 2015 S Ance 8 CORRECTION DIAPO
    3774 mots | 16 pages