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Alignement de 2 séquences

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Alignement de 2 séquences Programmation dynamique

Licence Biologie – L3 BioCell (2010-2011): Analyse in silico de séquences – Emmanuel Talla, Aix Marseille

Homologie

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Homologie
Gène ancestral

Gène A

homologue

Gène B

Spéciation Gène C Gène D Gène E

Duplication Gène F

orthologues

paralogues

CSR - Réunion du 18 juin 2001 / example.ppt 3

2 séquences sont homologues, ou ne le sont pas...

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Similarité de séquence, homologie et alignements de séquences Rechercher des homologues

=
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Alignements de séquences

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Quand 2 séquences sont-elles considérées comme homologues?

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Construire des alignements de séquences

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Construire des alignements de séquences

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Construire des alignements de séquences

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-Trop long (croissance exponentielle du nombre d'alignements possibles) -Tres peu efficace (recalcul des mêmes valeurs)
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