Arrivé à Cologne Cligès et Fénice tombent amoureux l'un de l'autre. Le neveu de duc de Sax est alors venu réclamer Fénice pour son oncle. Thessala, la nourrice de Fénice, apercevant la douleur qui est en elle, aussi bonne guérisseuse qu'experte en tous charmes diaboliques et envoûtements, lui proposa de la soigner. D'abord hésitante, Fénice finit par se confier à sa nourrice: Promise à Alis et aimant désespérément Cligès. Refusant de subir le même sort que Tristan et Iseut, sa nourrice lui proposa un philtre qui donnera à Alis l'illusion de l'amour. Car elle voulait préserver l'héritage de Cligès en ayant point d'enfant avec Alis. Les noces d'Alis et de Fénice sont célébrées, le philtre est ingénieusement proposé par sa femme à Alis, qui le boit.

Convoitant toujours Fénice, le duc de Sax et son armée guettent Alis et l'empereur d'Allemagne. Son neuveu surprend Cligès, qui l’abat, plusieurs barons sont à leur tour vaincus par Cligès, et le duc même, désarçonné s'enfuit. Mais grâce à un stratagème, il parvient tout de même à enlever Fénice, que Cligès ramène. Enragé, le duc propose un combat entre lui et Cligès pour décider du vainqueur. Cligès est ravivé par un cri de sa bien aimée, et vainc le duc dans le duel.

Afin d'honorer un promesse que Cligès fit à son père lorsque il mourut, il prit congé de son oncle et part à la cour d'Arthur, où a lieu un tournoi. Il combat pendant trois jour changeant chaque jour de cheval, d'arme et d'armure, gardant ainsi son anonymat. Le premier jour il se vêti d'une armure noire, ensuite d'une verte et pour finir une en vermeille (rouge). Chaque jour plus victorieux, il désarçonne successivement Sagrenor, Lancelot, Perceval et bien d'autres. Disparaissant après chaque tournoi il révèle enfin sa triple personnalité. Gauvain, neveu du roi Arthur, le défit. Le combat est interrompu par Arthur. Reconnu, Cligès séjourne à la cour, puis retourne à Constantinople afin de revoir Fénice.

Un moment seuls, les deux amants se déclarent