MICROBIOLOGIE CHAPITRE 2-6

TS1 B

PHYSIOLOGIE DES MICROORGANISMES

- CATABOLISME AZOTÉ 1 – GÉNÉRALITÉS / PLACE DU CATABOLISME AZOTÉ
Le catabolisme azoté correspond au catabolisme des molécules contenant de l’azote dans des proportions non négligeables : il peut donc s’agir des protides (protéines, peptides, AA), mais également des dérivés protéiques (urée), ou encore des bases azotées.

1.1. LES PROTIDES
1.1.1. PRÉSENTATION
Les protides sont des molécules universellement répandues chez tous les êtres vivants. Codés par le génome, ils participent à tous les aspects de la vie cellulaire et extra-cellulaire, que ce soit au niveau structural (architecture de la cellule), au niveau des transports (protéines de transport des hormones, de l’O2, récepteurs membranaires…), au niveau enzymatique ou encore à de nombreux autres niveaux (défense de l’organisme avec les AC, régulation de l’expression avec les protéines liant l’ADN…). La plupart des protides sont des composés quaternaires (c-à-d qui contiennent C, H, O et N), et certains contiennent en outre soufre. DÉFINITION : Ce sont des substances à base d’acides aminés. On classe les protides selon leur degré de complexification, depuis l’AA (unité la plus simple), jusqu’aux protéines (plus de 50 AA), en passant par les peptides (moins de 50 AA).

1.1.2. DÉFINITION ET STRUCTURE
1.1.2.1. Les Acides Aminés, Unités de Base Un ACIDE AMINÉ (ou  amino-acide) est un composé organique comprenant à la fois : - une fonction ACIDE CARBOXYLIQUE : – COOH - une fonction AMINE : – NH2 Ces deux fonctions (ou deux groupements) sont portés par le même C (noté C). Forme non ionisée : Forme ionisée :

NH2 R1 C H COOH

NH3 R1

+

C H COO

= forme ionique apolaire (Zwitter-ion) = forme prédominante en solution à pH neutre R = radical caractéristique de nature différente (H, CH3, CH2-CH3, CH2-SH…). Rôles : éléments constitutifs des protéines (dans la nature, on compte 20 AA principaux appelés protéinogènes, plus