Réaction en chaîne par polymérase

microarray, principal component analysis, clustering, linear model, random forests, canonical correlation analysis. 1. Introduction Les donn´es transcriptomiques, ou donn´es d’expression des g`nes, sont issues e e e de technologies vari´es (Polymerase Chain Reaction – PCR – en temps r´el, e e biopuces constitu´es d’acide d´soxyribonucl´ique – ADN – compl´mentaire e e e e ou d’oligonucl´otides d´pos´s sur membrane de nylon ou sur lame de verre), e e e chacune n´cessitant des pr´traitements sp´cifiques

stress est complexe et fait intervenir de multiples acteurs à différents niveaux de la machinerie cellulaire. Nous évoquerons les principaux acteurs des mécanismes de résistance. La régulation de la réponse au stress acide Les facteur σ L’ARN polymérase est composée de sous-unités permettant la polymérisation de l’ARN à partir de l’ADN, et d’une sous-unité σ permettant sa fixation à l’ADN. Différents types de sous unité σ existent. Interagissant avec les facteurs de transcription, ils permettent

années s’ils sont protégés d’une humidité excessive et d’une contamination bactérienne. Dès que l’échantillon est recueilli, le segment d’ADN intéressant est amplifié à l’aide d’amorces appropriées et d’une technique appelée amplification en chaîne par polymérase (PCR). L’allèle mutant et/ou normal est identifié directement par une différence dans l’ADN sur un gel. Un test d’ADN permettra de savoir si un chat est homozygote pour l’allèle normal, hétérozygote pour la mutation (“porteur” d’une maladie

l’information sensitive de la périphérie aux centres intégrateurs du système nerveux central. Les nerfs moteurs conduisent les impulsions générées par le système nerveux central jusqu’à l’organe cible. Le système nerveux végétatif Il a pour origine une chaîne de ganglions nerveux situés de part et d’autre de la colonne vertébrale. Il contrôle les fonctions végétatives de l’organisme, celles dont le contrôle n’est pas régi par le système nerveux central ou périphérique. Le système nerveux est impliqué dans

ORL PAVM PC PCA Haute Autorité de santé Haut Conseil de la santé publique Herpes simplex virus (virus de l’herpès) Infection associée aux soins Infection à Clostridium difficile Indice de consommation de solutions hydro-alcooliques Intra-dermo réaction Interferon gamma release assay (test de dosage de l’interféron gamma) Infection nosocomiale Institut de veille sanitaire Infection du site opératoire Infection tuberculeuse latente Infection urinaire Infection urinaire associée au sondage urinaire

utilis´ es pour illustrer ce cours sont effectivement des donn´ es d’expression e e e recueillies dans le cadre du G´ nopˆ le de Toulouse. Trois exemples de donn´ es transcriptomiques e o e ´e sont utilis´ es. Le premier a et´ obtenu par PCR (Polymerase Chain Reaction), les deux suivants e ` par puces a ADN sur membrane de nylon (macroarray). Dans chaque cas, le nombre de g` nes e ´ etudi´ s est limit´ : entre 36 et 871, alors que l’homme, comme la souris, en comporte environ e e ´e 30000. Les donn´ es