N bioinfo
1.
INTRODUCTION . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1
2.
QUELQUES NOTES HISTORIQUES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1
2.1.
3.
2.1.1.
Architecture client-serveur ..................................................................................................9
2.1.2.
Le Web............................................................................................................................9
2.1.3.
Délocalisation des ressources ............................................................................................ 10
BANQUES ET BASES DE DONNÉES BIOLOGIQUES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
3.1.
LES BANQUES DE SÉQUENCES GÉNÉRALISTES .......................................................................... 12
3.1.1.
EMBL (nucléique) .......................................................................................................... 13
3.1.2.
GenBank (nucléique)....................................................................................................... 16
3.1.3.
DDBJ (nucléique)........................................................................................................... 18
3.1.4.
PIR-NBRF (protéique)..................................................................................................... 20
3.1.5.
SwissProt (protéique) ...................................................................................................... 22
3.1.6.
Uniprot (protéique)......................................................................................................... 25
3.1.7.
Les systèmes d'interrogation des