N bioinfo

17544 mots 71 pages
Introduction à la bioinformatique
1.

INTRODUCTION . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1

2.

QUELQUES NOTES HISTORIQUES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1
2.1.

3.

2.1.1.

Architecture client-serveur ..................................................................................................9

2.1.2.

Le Web............................................................................................................................9

2.1.3.

Délocalisation des ressources ............................................................................................ 10

BANQUES ET BASES DE DONNÉES BIOLOGIQUES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
3.1.

LES BANQUES DE SÉQUENCES GÉNÉRALISTES .......................................................................... 12

3.1.1.

EMBL (nucléique) .......................................................................................................... 13

3.1.2.

GenBank (nucléique)....................................................................................................... 16

3.1.3.

DDBJ (nucléique)........................................................................................................... 18

3.1.4.

PIR-NBRF (protéique)..................................................................................................... 20

3.1.5.

SwissProt (protéique) ...................................................................................................... 22

3.1.6.

Uniprot (protéique)......................................................................................................... 25

3.1.7.

Les systèmes d'interrogation des

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