Modélisation moléculaire

Introduction
La modélisation moléculaire, est un ensemble de techniques dont la principale finalité est l’imitation du comportement des molécules. Autrefois destinée exclusivement aux théoriciens, elle est devenue aujourd’hui un outil de choix dans les laboratoires de plusieurs disciplines, allant de la chimie à la bioinformatique en passant par la protéomique. Cet outil qui joint l’utile à l’agréable, a connu un essor prodigieux ces 20 dernières années et pour causes une multitude de facteurs. En effet, l’introduction d’interfaces graphiques facilitant l’utilisation des codes de calculs, la mise en place d’ordinateurs de plus en plus puissants, et l’établissement de modèles de plus en plus raffinés collaborent à un tel développement. Cette technologie couramment utilisée, occupe une place de plus en plus importante tant dans les grands centres industriels de recherche et de développement que dans le secteur académique. Elle tend ainsi à diminuer les essais-erreurs, fort coûteux aussi bien d’un point de vue financier que d’un point de vue temporel. [1] Parmi tous ces domaines d’applications, c’est pour le domaine de la biologie que la modélisation est d’une grande aide. Elle représente en effet un outil particulièrement indispensable à l’étude de la structure des biomolécules et des protéines, dont la connaissance est impérative à une bonne compréhension de leur fonction. Elle permettra d’ailleurs par la suite la proposition d’éventuelles solutions thérapeutiques, puisque la quasi-totalité des pathologies sont dues à des disfonctionnement des protéines et des altérations de leur structure [2].

Aperçu historique
Même si les premiers travaux faisant allusion à la structure 3D des molécules datent du 19ième siècle, ce n’est que vers les années cinquante du siècle dernier que le concept structure/fonction a vu le jour [3]. En 1953, Watson et Crick ont révélé au monde entier leur modèle 3D de l’ADN, le modèle moléculaire le plus célèbre