Une éducation peu ordinaire Michel Eyquem naît le 28 février 1533, au château de Montaigne dans le Périgord. Sa famille s'est enrichie en pratiquant le négoce de poisson séché, de pastels et de vin. Son arrière grand-père, Ramon Eyquem, avait fait l'acquisition en 1477 d'une maison forte du XIVe siècle, à Saint-Michel-de-Montaigne, dans le Périgord, et accéda ainsi au noble statut de « Seigneur de Montaigne » qu'il transmit à ses enfants et petits-enfants.Sa mère, Antoinette, est d'origine espagnole, et se convertit au protestantisme, tandis que son père, Pierre, reste catholique. Les enfants choisiront librement leur religion, et de ce modèle de tolérance Montaigne apprend très tôt l'ouverture d'esprit. Son pére épousa en 1528 Antoinette de Louppes, fille d'un marchand toulousain et d'origine marrane. Les deux premiers enfants du couple meurent en bas âge ; Michel, né le 28 février 1533, est le premier qui survit.
Il sera l'aîné de sept frères et sœurs.

Son Pére Pierre Eyquem n'a aucun goût pour les activités commerçantes de sa famille, et préfère, une fois anobli en 1519, s'engager dans l'armée auprès de François Ier, notamment dans les guerres d'Italie .
De ce pays il rapporte les idées nouvelles véhiculées par les humanistes qui propose de renouer avec les valeurs, la philosophie, la littérature et l'art de l'Antiquité classique qu'ils considère comme le fondement de la connaissance. Il confie son fils à une nourrice puis le récupère pour l'instruire.Pierre Eyquem, qui est nommé maire de Bordeaux en 1544, donne à son fils aîné une éducation dans les principes humanistes:
L'éducation de Michel sera très libre : un précepteur(médecin)allemand nommé hortanus lui apprend le latin, qui devient sa langue maternelle. Vers 1540, Michel de Montaigne, ne sachant que le latin, est scolarisé au collège de Guyenne à Bordeaux, haut lieu de l'humanisme bordelais, où il apprend le français, le grec, la rhétorique et le théâtre. Il y brille