tp enzymologie fondamentale et moléculaire

7820 mots 32 pages
USJ1
Année 2022 – 2023

Licences
Sciences de la Vie et de la Terre-Biochimie et Chimie

Pr Richard G. Maroun
EFMBL4
Travaux dirigés Enzymologie fondamentale et moléculaire 2
TABLE DES MATIERES

I- Interaction protéine-ligand : caractérisation des sites de fixation page 3
II- Enzymes michaeliennes page 4

III- Inhibiteurs enzymatiques page 8

IV- Enzymes allostériques page 16

V- Cinétiques à plusieurs substrats page 19

VI- Étude des sites actifs
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L’enzyme réisolée ne porte pas de radioactivité. Si on la met en présence de 3H-succinate on obtient la formation de succinyl-CoA tritié. Conclusions ? 2ème Exercice
La créatine kinase du muscle catalyse, en présence de Mg2+, la réaction (1) : (1) créatine + ATP2- + Mg2+ ↔ ADP- + phosphocréatine + H+ La phosphorylation de la créatine peut être mesurée à l’aide d’un système couplé faisant intervenir les 2 réactions suivantes : pyruvate kinase
(2) ADP + phosphoénolpyruvate + Mg2+ ATP + pyruvate lacticodéshydrogénase
(3) pyruvate + NADH + H+ lactate +
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En électrophorèse sur gel de polyacrylamide en présence de SDS et d’urée la protéine semble également homogène et la masse moléculaire apparente est de 80000 Da. Quelles hypothèses peut-on formuler sur la structure de E ? (6 points)

2- On réalise par la suite, en milieu non dénaturant, une chromatographie sur colonne échangeuse d’ions (DEAE-cellulose) de l’enzyme pure. Les profils d’élution obtenus pour l’absorbance à 280nm (trait plein) et pour l’activité enzymatique (pointillés) sont montrés sur la figure 1. Nous rappelons que les acides aminés aromatiques des protéines absorbent à
280nm.

I
III
Absorbance à 280nm
Activité enzymatique II
0 20 40 60 80 n° de

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