Cristallographie aux rayons X

2014-2015 Travaux Dirigés Mécanique quantique Physique des solides Semiconducteurs CSI3 – U3 Enseignants : I. Lefebvre, X. Wallart, B. Grandidier, J.F. Robillard, C. Croënne, A. Devos, C. Delerue Introduction à la dualité onde-corpuscule Relations de De Broglie A la fin du XIXème siècle, la Physique Classique se divisait en 2 domaines : - la Physique des particules et des solides régie par les lois de la Mécanique Classique développées depuis Newton (XVIIème siècle) - La Physique ondulatoire

Les rayons X en médecine Problematique: comment les rayons X peuvent ils etre a la fois benefique et comportant des inconvénients? Les rayons X ont été découverts en 1895 parW.Röntgen en Allemagne. Il baptise les rayons qu’il a découvert “Rayons X” avec le “X” comme l’inconnue en Mathématiques.Marie Curie met sur pied le premier service important d'imagerie médicale en France. Les rayons X permettent au médecin de faire un diagnostic non seulement plus rapide, mais aussi plus sûr. I. Découverte

Le nombre de séquences dans SWISS-PROT est voisin de: 500000 18. La matrice PAM 25 est plus adaptée pour les séquences proches que la matrice PAM 250 VRAI 19. Dans la PDB, le nombre de structures résolues par RMN est plus grand que par cristallographie FAUX 20. Quand la taille d'une molécule augmente, son énérgie en mécanique moléculaire diminue 21. La sensibilité est égale a (VP vrai positif, VN vrai négatif,FP Faux positifs, FN Faux négatifs) VP/(VP+FN) 22. Le Z-score est indépendant

structures 3D possibles (coude, hélice, feuillet β…) • Structure d’une protéine : – Résolution expérimentale de la structure : RMN-2D ; Rayon X – Récupération dans une base de données – Modélisation par homologie L1-PACES 2.1.1 Méthodes expérimentales Cristallographie sous rayon X – Cristallisation de la protéine – Résolution de la densité électronique par rayon X • Obtention de la carte de densité électronique • Détermination de la position et nature des atomes L1-PACES 2.1.1 Méthodes

diffracte la lumière. I.2 Diffraction par une fente simple (largeur a, hauteur h>>a ). Dans les conditions de Fraunhofer, le calcul de l'intensité diffractée dans la direction θ donne : I.3 Diffraction par une ouverture circulaire de rayon R Toujours dans les conditions de Fraunhofer, le calcul de l'intensité diffractée dans la direction θ donne : [pic] avec [pic]et où [pic]est la fonction de Bessel du 1er ordre. On observe donc des anneaux alternativement brillants et sombres.

Linus Pauling et Robert Corey en 1951[3], à partir de considérations théoriques, avant d'être observée effectivement pour la première fois en 1958 dans la myoglobine, la première protéine dont la structure tridimensionnelle a été résolue par cristallographie. Hélice 310 L'hélice 310 se caractérise par la formation d'une liaison hydrogène entre le groupement -CO d'un résidu i et le groupement -NH d'un résidu i+3. Un pas d'hélice 310 moyen contient 3 résidus et mesure 0.60 nm, soit une translation

et un jours plus tard.   [pic] [pic] Représentation schématique de la myoglobine. Cette protéine homologue de l'hémoglobine se lie au dioxygène au niveau des muscles. Elle est la première dont la structure est résolue par cristallographie et diffraction des rayons X par Max Perutz et John Kendrew. Une protéine est une macromolécule biologique composée par une ou plusieurs chaîne(s) d'acides aminés liés entre eux par des liaisons peptidiques. En général, on parle de protéine lorsque la chaîne

de dix et quatre chiffres significatifs. (1 point) Exercice 2 (5 points) On se propose de déterminer une distance macroscopique et une distance microscopique. I – Distance macroscopique Distance entre l'étoile Astarion et la Terre. Donnée: rayon de l’orbite terrestre ( R = 1 ,5 ⋅ 10 8 km). Rappeler la méthode de la parallaxe utilisée en astronomie après avoir complété le schéma page suivante (on notera où se trouvent le Soleil, la Terre et l'étoile Astarion). (1 point) 139 Devoir n°

....................................................................................... 11 8. Annexes : ........................................................................................................................... 13 Annexe I : Cristallographie............................................................................................. 13 La danse du ferrofluides 1 Annexe II : Le superparamagnétisme, et le ferrofluide bloqué .............................. 16 Annexe III : Un ferrofluide

1953 de la structure en double hélice de la molécule d'ADN par Francis Crick et James Watson. En effet, la découverte récente d'une correspondance entre Crick et Maurice Wilkins montrerait que cette découverte serait en fait du aux études de cristallographie de Rosalind Francklin! Bien entendu cette dernière n'est pas inclue dans le prix Nobel que reçurent Cricks, Watson et Wilkins. Malgré tout, le fait que maintenant, le nom de Rosalind Francklin apparaisse montre que déjà un changement de mentalité